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RNA測序技術

2010-10-14  閱讀(3967)

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摘要: 來自美國特拉華大學的科學家們在小分子RNAs研究方面做出了重大貢獻:他們發現擬南芥中的RNAs實際數目比以前所知的多10倍以上。

來自美國特拉華大學的科學家們在小分子RNAs研究方面做出了重大貢獻:他們發現擬南芥中的RNAs實際數目比以前所知的多10倍以上。

小分子RNAs是近十年來生命科學界zui重要的發現之一,這些核糖核酸雖然小,但是卻在動植物基因調控中扮演著重要的角色。植物體內如果缺乏小分子RNAs就會對植物生長有復雜長久的影響,而且小分子RNAs也參與了其它一些重要的生理過程,比如抗逆性。

為了能夠了解生物機體中小分子RNAs的整體作用與個體生物角色,確定體內RNAs的序列是十分之必要的。雖然之前也有不同動植物的幾千個小分子RNAs被測序確定,但是這些傳統方法不能夠在基因組的水平上進行完整的測序,得到的結果缺乏豐度和整體規則感。

特拉華的研究人員利用一種稱之為“大規模平行信號測序系統”(Massively Parallel Signature Sequencing,MPSS)轉錄組分析技術的方法來進行擬南芥的測序。這一由英國劍橋大學獨立出來的Solexa公司開發的技術(現Takara也在其DNA Micro-beads Array技術中運用)是一種利用EST序列數據庫分析基因轉錄信息的分析方法,改善了之前令科學家頭痛的耗時耗力的實驗過程。

利用這一技術,研究人員完成了擬南芥種子和花朵22,000,000個小分子RNAs的測序,并發現了75,000個未發現的小分子RNA序列。而在這之前,擬南芥中總共也才測序了6,000個小分子RNAs。而且利用MPSS得到的結果數量多,質量也較好,在這項研究中,研究者們發現了許多高調控的小分子RNAs。

除了獲得了序列信息,特拉華大學研究人員也發現了一個令他們驚訝的結果:之前推測認為非轉錄活性區域被證明是龐大數量小分子RNAs的活性區域。這些發現對于未來RNA和轉錄調控的研究有非常重要的意義,并且也預示著這一領域的研究在將來一定會蓬勃發展。

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