實驗目的:
學習從兔肝中提取RNA的方法。
通過地衣酚顯色法測定RNA的含量。
實驗原理:
細胞內大部份RNA均與蛋白質結合在一起,并且多以核蛋白的形式存在。因此,分離制備RNA時,首先遇到的是必須使RNA與蛋白解離,并除去蛋白質。由于RNA的種類來源和存在形式不同,所用的制備方法各異,一般常用的方法有,鹽酸胍法,去污劑法和法。其中,以法使用較為廣泛。產品純度高,適合小規模生產。
動物組織中以肝臟器官RNA含量較為豐富。經組織勻漿用處理并離心后RNA溶于上層被酚飽和的水相中,DNA和蛋白質則留在酚層中,向水層中加入乙醇后,RNA即以白色絮狀沉淀析出。此法能較好的除去DNA和蛋白質。上述方法提取的的RNA具有生物活性。工業上常用稀堿法和濃鹽法提取RNA;其工藝簡單,所提取的核酸均為變性RNA,只能用作制備核苷酸原料。本實驗就是將兔肝組織,在酚與十二烷基硫酸鈉的存在下,RNA與蛋白質分離使蛋白質變性凝固。RNA溶解在水相中,用乙醇使RNA從水相中沉淀,達到分離。
RNA含量的測定,除了可用紫外吸收法及定磷法外,常用地衣酚法測定,其反應原理是當RNA與濃鹽酸共熱時,即發生降解,形成的核糖繼而轉變成糠醛,后者與3, 5-二羥甲苯(地衣酚orcinol)反應,在Fe3+或Cu2+催化下,生成鮮綠色的復合物.反應產物在670nm處有zui大吸收。RNA在20-250微克范圍內,光吸收與RNA濃度 成正比。地衣酚反應特異性較差,凡是戊糖均有此反應。DNA和其他雜質也能給出類似的顏色。
實驗試劑
0.05mol/L醋酸緩沖液(PH5.0)
0.05mol/L醋酸鈉35毫升, 0.2mol/L醋酸15毫升,加蒸餾水至1000毫升,混合后測PH5.0
25%SDS:稱取SDS25克,溶于50%乙醇中至100毫升,室溫存放。
80%酚:取80份,加蒸餾水20份,混勻后裝棕色瓶中。
2mol/L醋酸鈉:取無水醋酸鈉16。4克,用蒸餾水溶解后配成100毫升
95%乙醇
操作步驟
RNA提取:將新鮮兔肝浸入預冷0度0.05mol/L醋酸鈉緩沖液(PH5.0)中,除去肝臟處的結締組織,除去血凝,用濾紙吸干,稱取0.9克.
取0.9克肝臟,加入 0.05mol/L醋酸緩沖液(PH5.0)9毫升,250克/升.SDS1.5毫升,移入勻漿管中,勻漿后再加入等體積80%酚,再勻漿一次.
移入三角瓶中,置65度水浴中繼續振搖5-8分,取出流水冷卻.
離心,3000轉/分,10-15分,上層為稍混濁,含有RNA的水相,中層為變性蛋白,下層為酚液,管底殘渣,含有RNA.吸出上層水溶液要RNA的收獲量,可向中下層液中再加1/2體積的醋酸緩沖液,同樣在65度水浴中振搖提取一次,離心后所收得的上層水液,可與上述水液合并,本次實驗只提取一次.
用量筒測水液的量,加入1/10體積的2mol/L醋酸鈉混勻.再加入2.5倍體積預冷的95%乙醇混勻,冷卻放置絮狀沉淀充分形成.
離心3000轉/分,10分鐘,傾出上清(不要廢棄,可倒入收集瓶,作蒸餾回收乙醇用.
沉淀用蒸餾水4毫升溶解,慢慢向沉淀中加入蒸餾水,不斷攪拌,至沉淀*溶解即可,待作含量測定.
提取過程
RNA含量測定
標準曲線制作:取試管12只,按下表編號加入試劑,加畢,搖勻,沸水浴中加熱25分鐘,取出后冷水冷卻,測定各管0D670為縱坐標,RNA濃度為橫坐標作圖
測定過程
管號/試劑ml
0
1
2
3
4
5
6
7
RNA標準液
0
0.4
0.8
1.2
1.6
2.0
蒸餾水
2.0
1.6
1.2
0.8
0.4
0
地衣酚試劑
2.0
2.0
2.0
2.0
2.0
2.0
取兩支試管各加入0.2ml待測液,再加1.8ml水和2.0ml地衣酚試劑,加畢,搖勻,沸水加熱25分鐘,取出后冷水冷卻,測定各管OD680為縱坐標,RNA濃度為橫坐標作圖并計算提出的RNA 的量。并計算出RNA的收率.