科學家構(gòu)建引發(fā)炎癥性疾病的Th17細胞調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

這些細胞被免疫學家稱為T細胞，T細胞在對抗感染中發(fā)揮關(guān)鍵作用。但T細胞也可誘發(fā)炎癥和組織損害，在幾種常見的炎癥性疾病進程中起一定作用。T-細胞也是以免疫細胞為基礎(chǔ)的開展癌癥治療的關(guān)鍵。分子免疫學和病理學教授Dan Littman博士說：我們一直在努力明白是什么讓炎癥性T淋巴細胞如此特別。它們既可以保護我們抵抗微生物，同時又有可能引發(fā)自身免疫性疾病。

近日，紐約大學醫(yī)學院研究人員領(lǐng)導的一個研究小組在研究導致炎癥性疾病如克羅恩病、多發(fā)性硬化和關(guān)節(jié)炎的Th17細胞中取得了新進展。論文作者、約約大學基因組學和系統(tǒng)生物學Richard Bonneau副教授說，研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)數(shù)百種新的基因都參與調(diào)控這些細胞的功能。這項研究的結(jié)果可以作為一個知識框架，幫助我們設(shè)計新的治療方法以治療各種免疫系統(tǒng)疾病。

研究人員表示很幸運能夠形成如此一個團隊包括了免疫學、計算生物學和基因組學方面的專家來共同解決這個難題。在此之前，我們只知道影響這些細胞功能的少數(shù)幾個基因，現(xiàn)在我們知道了數(shù)百個新的基因。我們希望可以針對一些新的分子治療這些疾病。

相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在一期的Cell雜志上，論文揭示了這些細胞通過龐大的監(jiān)控網(wǎng)絡(luò)如何調(diào)節(jié)自身基因組。這項研究側(cè)重于輔助性T細胞17（Th17細胞）以及它們是如何調(diào)節(jié)數(shù)以千計的染色體區(qū)域基因產(chǎn)物的合成。Th17細胞先前已被證實與炎癥性疾病有關(guān)，一些其他研究也發(fā)現(xiàn)Th17細胞數(shù)百個基因在促炎癥性疾病中發(fā)揮一定作用。這項新的研究將這些有關(guān)的基因與細胞發(fā)育時間表，并zui終使他們一體的綜合模型類分析基因是如何相互作用。

為了探索這些細胞的內(nèi)部工作原理，研究人員利用一種系統(tǒng)生物學方法重點測量多個生物分子以捕獲多個細胞生物體基因的相互作用。例如，在本研究中的一個數(shù)據(jù)集包含了基因表達、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)或基因染色體相互作用、基因組的位置等信息。

研究人員采用了統(tǒng)計技術(shù)從大量的數(shù)據(jù)中開發(fā)了一個網(wǎng)絡(luò)模型，為了驗證計算機建模的準確度，進一步進行了小鼠動物實驗。研究人員建立的計算機模型確定了幾個人能影響超過2000個基因表達，在調(diào)節(jié)Th17細胞中發(fā)揮重要作用的候選基因。這些基因作為Th17細胞中基因表達或抑制的調(diào)節(jié)開關(guān)，是潛在的*新靶點。

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