繼2008年、2009年成功評選出“生命科學創新產品”之后,生物通于2010年11月第三度推出“生命科學創新產品”評選活動。在這次活動中,我們共收到50個候選產品。經過三個月的讀者投票和專家評鑒,2010生命科學創新產品終于出爐……
*,5-甲基胞嘧啶(5-mC)是哺乳動物基因組DNA中主要的表觀遺傳學標志。除此之外,研究人員zui近還發現了一種新的表觀遺傳學修飾——5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)。它在表觀遺傳學上的功能可能與5-mC不同。盡管到現在為止還不確知其功能,有研究人員猜測它在調控基因的表達與關閉過程中起著重要的作用?,F有技術能夠鑒定出基因組DNA中的5-mC,但是卻無法區分5-mC和5-hmC。
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此,New England Biolabs(以下簡稱NEB)推出了EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析試劑盒。此試劑盒是市場上*個定量5-hmC的PCR型分析,且操作簡便,只需三步。它利用T4 β-葡萄糖基轉移酶(T4-BGT)在5-hmC的羥基上添加葡萄糖,從而區分5-mC和5-hmC。當5-hmC出現在CCGG的背景下,這種修飾將一個可切割的MspI位點轉化成不可切割的。此外,這種方法還能與現有的分析技術兼容,從而擴展到高通量。
這種創新的工具簡化了表觀遺傳學研究,能幫助我們了解5-hmC在表觀基因組中的作用,對疾病相關生物標志物的開發很關鍵。因此,它也被評為“2010生命科學創新產品”。為此,生物通就一些讀者感興趣的問題,采訪了NEB公司市場部的余。
生物通:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析試劑盒的*之處在哪里?
NEB:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析試劑盒能夠在特定的基因位點上識別并定量5-hmC和5-mC,是*個研究、區分5-hmC和5-mC的試劑盒。這個三步法試劑盒將會對您研究表觀遺傳學、DNA甲基化,特別是研究5-hmC有所幫助。
生物通:除了此試劑盒,NEB公司還提供了哪些表觀遺傳學研究試劑?
NEB:NEB 公司提供一系列甲基化依賴性以及對甲基化呈現不同敏感性的限制性內切酶,這類內切酶可以將 DNA 切割成適當片段,有利于甲基化的分析與研究。MspJI 系列內切酶是屬于依賴甲基化和羥基甲基化而發揮作用的內切酶,可以將 DNA 切割成以 5-hmC (5-羥甲基胞嘧啶) 和 5-mC (5-甲基胞嘧啶) 為中心的 32 個堿基片段,通過對這些片段的分離、測序,就能繪制出表觀遺傳學特定修飾位點圖譜。
NEB 公司還提供多種 DNA 甲基轉移酶,用于基因表達研究,可以針對 DNA 特定位點進行甲基化修飾。特別是 CpG 甲基轉移酶尤其適用于研究 CpG 甲基化對基因表達及功能的影響。
除上所述,NEB 公司還提供各種甲基化和非甲基化修飾的基因組 DNA,可以作為各種表觀遺傳學研究的對照樣品。
在組蛋白研究方面,NEB 公司還提供各種類型的組蛋白,這些組蛋白均為沒有任何翻譯后修飾的高純度重組蛋白質,可作為對照底物,研究修飾組蛋白的酶類;同時這些組蛋白還可以聚成八聚體,研究哪些結合后才能發揮作用的組蛋白或 DNA。
來源:生物通
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