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2008年，由美國次貸危機引發的金融危機，波及到了世界各個國家和各行各業，許多行業在此次危機中都受到重創。然而，對于醫藥行業而言，尤其是中國的醫藥行業，由于其自身的特點，受到的沖擊相對較小。2008年，生物制藥行業整體經濟運行仍保持增長態勢。2008年1-12月，中國生物、生化制品的行業規模以上企業實現累計工業總產值76,726,994千元，比2007年同期增長了30.32%。可以說，在金融危機下，由于國內的經濟和政策大環境的影響，我國醫藥行業的競爭優勢可能更加明顯，這也是醫藥行業面臨的機會。生物制藥作為成長性產業在醫藥行業中的地位也越來越突出。
2009年金融危機導致經濟衰退嚴重，中國經濟也面臨著周期性調整和結構性調整雙重壓力，醫藥工業運行環境將趨于嚴峻。但隨著醫療衛生體制改革的積極推進，市場規范化程度的提升，中國醫藥工業將繼續保持快速增長勢頭。化學原料藥、生物生化、獸藥等幾個子行業保持活躍，其收入增速和利潤增速都超過了整個業。傳統的大行業中，化學制劑與行業平均水平保持同步，而中成藥則在收入和利潤方面都不及行業平均水平。受新醫改對醫藥衛生市場的擴容影響，醫藥業近兩年維持了較高速度的發展，收入增長維持在25~30%左右，預計2009、2010年復合增速為15%左右。生物制藥業在這樣的有利環境下，增速將超過醫藥產業中的其他行業。
從長遠來看，雖然經過多年的發展，中國生物醫藥產業已經有了一個良好的基礎，但是與*國家的生物醫藥產業相比，中國生物醫藥產業還存在不少差距。中國生物醫藥產業的發展從科研到產業化，將是一條艱難的路。近年來，從國家到地方各級政府不斷加大力度支持生物醫藥產業的發展。預測到2020年左右，我國生物技術研究開發與產業化整體達到*國家水平，生物產業總產值達到25000億至30000億元。而生物制藥作為生物產業重要的一環，毋庸置疑將受到更多的關注與支持。2009年國家發展改革委安排新增中央投資4.42億元，支持生物醫藥、生物育種、生物醫學工程高技術產業化專項以及國家生物產業基地公共服務條件建設專項的建設。此舉可直接帶動社會投資40億元，對于促進高技術產業化、推動生物等戰略性新興高技術產業的發展具有重要作用
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