基因組測序法可對疫情暴發進行追蹤

【資料簡介】

基因組測序法可對疫情暴發進行追蹤
研究者利用全基因組測序已經追查到去年在歐洲大范圍致病的大腸桿菌（E.coli）暴發路徑。這是*個采用基因組測序的方法來研究食源性暴發的動態，由此為了解未來疫情和傳染病的出現和蔓延提供了新途徑。
利用全基因組測序已經追查到去年在歐洲大范圍致病的大腸桿菌（E.coli）暴發路徑。

這是*個采用基因組測序的方法來研究食源性暴發的動態，由此為了解未來疫情和傳染病的出現和蔓延提供了新途徑。這項研究的合作者還包括法國巴斯德研究所、丹麥國立血清研究所等。

在生物學中，一個生物體的基因組是指包含在該生物的DNA（部分病毒是RNA）中的全部遺傳信息。確定哪些DNA變異導致特定性狀或疾病則需要進行個體間比較。該研究的主要作者、傳染性疾病動態中心研究者永納坦·格拉德說，尋找疫情暴發的多種細菌的基因組之間的差異，即可得到疫情發生的線索。像做偵探工作一樣，研究人員通過這種方式跟蹤疫情，可了解未來疾病暴發路徑。

去年夏天在德國，因大腸桿菌病毒的肆虐成千上萬人生病，50多人死亡，之后在法國也引起了小范圍的暴發。研究人員將這兩國的致病大腸桿菌株對比分析，發現菌株相同。然而，利用全基因組測序分析菌株之間的差異時，研究人員發現：所有與德國當地相關暴發的菌株都幾乎是相同的，而出現在法國菌株表現出更大的多樣性，顯示出是從德國菌株分離出來的一個子集。

隨著基因組測序成本的下降，未來將其與傳統的流行病學方法相結合，可以為人們對傳染病的出現及蔓延提供更深入的了解，將有助于指導公共衛生預防措施。基因組測序法可對疫情暴發進行追蹤