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土壤DNAout

時間:2013-6-26閱讀:1045
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土壤DNAout
產(chǎn)品及特點 由于土壤中有機質(zhì)含量豐富,尤其是其中的腐殖酸對PCR等后續(xù)反應(yīng)有的抑制作用,所以從土壤微生物提取高純度的DNA一直是十分棘手的問題。本產(chǎn)品是天澤基因精心優(yōu)化的專門用于從各種土壤樣品和河海沉積物中提取高質(zhì)量的DNA的試劑。
. 去污染效果好,OD260/280一般都在.8以上, OD260/340一般都在3.0以上(表示腐殖酸少),得到的DNA樣品原液或稀釋液可以直接用于PCR等后續(xù)反應(yīng)。
2. 產(chǎn)量高,每克土壤一般可以提取到5 ug 左右DNA,片段長度在30 Kb左右。
3. 操作過程簡單快速,只需要30分鐘。
4. 擴容性好,既可以在.5 mL離心管中微量提取,也可以在50 mL離心管中進(jìn)行大規(guī)模制備。
5. 試劑無毒無害, 環(huán)保。
規(guī)格及成分 成 份 30 次包裝 00 次包裝
溶液A 5 mL 50 mL
溶液B 5 mL 50 mL
使用手冊 份 份
注:溶液A和溶液B均為無色液體,溶液A 4℃保存時會產(chǎn)生沉淀,用前需要65℃溶化并混勻。

運輸及保存 常溫運輸及保存,有效期一年。
自備試劑 氯仿、無水乙醇、75%乙醇。
使用方法 . 65℃預(yù)熱溶液A,待其沉淀溶化后,充分混勻,取0.5 mL加入到.5 mL塑料離心管中并放置于65℃待用。
2. 稱取0.-0.3 g的土壤,加入到含預(yù)熱溶液A的離心管中,震蕩器上劇烈震蕩5-0分鐘。如果是擴量操作,可以使用更多土壤和較大離心管。也可以將同一種土壤在較大離心管中震蕩處理,然后再分到.5 mL離心管中。注意:不論使用大的還是小的離心管,一定要讓管底的土壤震蕩起來。
3. 將離心管置于65℃水浴中保溫至少5分鐘。
4. 3000-5000 g室溫離心3分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到一新離心管中(上清液一般呈淡黃色或深棕色,具體取決于腐殖酸的含量,上清的體積一般為300-400 µL)。
5. 在上清液中加入等體積的溶液B,上下顛倒30秒充分混勻,溶液將呈白色或淡黃色混濁狀。
6. 將離心管冰浴至少5分鐘。
7. 3000-5000 g室溫離心3分鐘,轉(zhuǎn)移上清到新的.5 mL離心管中,上清液顏色將比第4步得到的上清的顏色稍淡,體積在0.7 mL左右。
8. 加入0.2 mL的氯仿(自備),震蕩器上充分振蕩30秒混勻。注意:一定要讓管底的溶液震蕩起來。
9. 3000-5000 g室溫離心3分鐘,小心轉(zhuǎn)移上清到新離心管中。說明:離心后兩相交界面將有白色膜狀物,其中有機相部分顏色較深,一般呈淡棕色。上清的顏色取決于土壤中腐殖酸的含量。
0. 重復(fù)第8步和第9步一次。zui后將上清轉(zhuǎn)移到新的.5 mL離心管時,不要超過0.5 mL,否則沒有空間加兩倍體積的乙醇。如果有多余的可以棄之不用。
. 加入2倍體積的乙醇(自備),上下顛倒30秒混勻,5000 g離心5分鐘,棄上清,管底將有微小DNA沉淀,有時候呈棕色。注意:不要用異丙醇代替乙醇,否則腐殖酸更容易于DNA共沉淀。
2. 加入mL 75%乙醇,震蕩,3000-5000 g室溫離心3分鐘,棄上清。
3. 重復(fù)上步清洗一次。注意:75%乙醇洗兩次有助于去除部分腐殖酸。
4. 短暫離心,吸棄殘留的75%乙醇(約50uL),室溫晾干。注意:一定要去除殘留的75%乙醇,否則會影響后續(xù)反應(yīng)和電泳上樣(樣品會飄走)。
5. 加入30 uL TE緩沖液溶解沉淀。注意:不知道樣品土壤DNA產(chǎn)率前不要加過多TE,如果DNA濃度高,可以再加TE稀釋。
6. DNA即可用于電泳、酶切和PCR等反應(yīng)。 電泳時采取電泳后染色,因為實驗發(fā)現(xiàn),殘留腐殖酸會吸附走大量的EB,使在腐殖酸后面的DNA不能染色。PCR時,按終體積的/0加入隨贈的PCR抑制物清除劑(CAT#:60804)。
 

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