預(yù)測(cè)小分子抗癌活性有了新算法

時(shí)間：2012-12-19閱讀：360

記者從中科院昆明動(dòng)物研究所獲悉，該所李功華博士在研究員黃京飛的指導(dǎo)下，開(kāi)發(fā)了一個(gè)新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對(duì)算法，并成功應(yīng)用于預(yù)測(cè)小分子的抗癌活性。近日，該研究發(fā)表在*計(jì)算生物學(xué)雜志《生物信息學(xué)》上。

據(jù)李功華介紹，開(kāi)發(fā)新的抗癌藥物是科學(xué)界和醫(yī)學(xué)界的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。直接采用實(shí)驗(yàn)的方法篩選抗癌藥物具有花費(fèi)大、時(shí)間長(zhǎng)的特點(diǎn)。以小分子為例，現(xiàn)在已知的小分子化合物超過(guò)了1000萬(wàn)個(gè)，因此，直接采用實(shí)驗(yàn)的方法從這1000萬(wàn)個(gè)化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此，建立一個(gè)、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計(jì)算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對(duì)發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。

為建立抗癌藥物活性的計(jì)算生物學(xué)預(yù)測(cè)系統(tǒng)，李功華開(kāi)發(fā)了一個(gè)新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對(duì)算法，通過(guò)交叉驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)其預(yù)測(cè)的線下面積達(dá)到了0.878，顯示該算法能很好地預(yù)測(cè)藥物小分子的抗癌活性。

同時(shí)，李功華還開(kāi)發(fā)了一個(gè)簡(jiǎn)便易用的預(yù)測(cè)抗癌藥物活性的網(wǎng)頁(yè)服務(wù)器，使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者所應(yīng)用。

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