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基因型檢測(cè)芯片試劑盒檢測(cè)原理

點(diǎn)擊次數(shù):977 發(fā)布時(shí)間:2012-8-6

基因是脫氧核糖核酸(DNA)分子中含有特定遺傳信息的一段核苷酸序列,是遺傳物質(zhì)的zui小功能單位。DNA結(jié)構(gòu)中的單個(gè)堿基序列發(fā)生變異就構(gòu)成了單核苷酸的多態(tài)性(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)我們把包括SNP在內(nèi)的不同基因結(jié)構(gòu)稱為不同的基因型。不同的基因型可以幫助解釋不同的人種、人群、個(gè)體對(duì)疾病易感性的不同,以及對(duì)藥物的不同反應(yīng)能力等,在對(duì)病人的個(gè)性化治療以及健康人的疾病預(yù)防上具有重大義!

基因型檢測(cè)芯片試劑盒就是根據(jù)不同基因的SNP信息,利用*的基因芯片技術(shù)而研制的。

檢測(cè)原理:基于生物樣本中基因靶序列與固定有基因探針的基因芯片進(jìn)行特異性雜交,經(jīng)過(guò)酶促顯色反應(yīng),給出待檢基因的SNP信息的方法。

一.芯片制造原理:芯片制造原理DNA探針(寡核苷酸片段,與被檢測(cè)的靶DNA互補(bǔ))溶液與點(diǎn)樣緩沖液以1:1比例混合[點(diǎn)樣緩沖液可大大增加點(diǎn)樣效果的穩(wěn)定、提高檢測(cè)靈敏度],通過(guò)點(diǎn)樣儀點(diǎn)到醛基基片上,然后用芯片活化液固定[芯片活化液可使醛基修飾載玻片上醛基的活性增強(qiáng),提高氨基修飾基因探針的固定效率]。固定后DNA探針將與醛基玻片共價(jià)結(jié)合,形成陣列;完成芯片制作過(guò)程。

二.抽提原理:抽提原理

通過(guò)向樣本中加入抽提液,溫浴、離心等操作,使樣品中的細(xì)胞裂解,釋放出DNA;同時(shí)使蛋白變性沉淀,完成樣本DNA的抽提。DNA提取純化試劑盒提取的DNA可以直接用于PCR擴(kuò)增,無(wú)需酚和氯仿抽提,無(wú)需乙醇沉淀,具有時(shí)間短、操作簡(jiǎn)便、無(wú)毒無(wú)害的特點(diǎn)。

三.擴(kuò)增液制造原理:擴(kuò)增液制造原理

抽提獲得的染色體DNA濃度太小,直接進(jìn)行雜交檢測(cè)無(wú)法獲得信號(hào)。將抽提獲得的染色體DNA作為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增(同時(shí)對(duì)靶DNA進(jìn)行標(biāo)記),擴(kuò)增產(chǎn)物的濃度足夠雜交檢測(cè)的需要。PCR的反應(yīng)過(guò)程是將人工合成的兩條寡聚核苷酸引物(兩條短的DNA 片段)聚合酶和靶DNA經(jīng)過(guò)一系列的升降溫循環(huán)來(lái)擴(kuò)增DNA,、寡聚核苷酸引物雜交到靶DNA上,為聚合酶(Taq酶)提供了延伸起始位點(diǎn),然后在兩個(gè)引物之間復(fù)制合成靶DNA序列。一個(gè)循環(huán)產(chǎn)生兩個(gè)復(fù)制模板,兩個(gè)循環(huán)產(chǎn)生四個(gè)復(fù)制模板,依次類推,PCR30循環(huán)就可以產(chǎn)生100萬(wàn)個(gè)靶序列的復(fù)制模板。因此只需從樣本中抽提少量DNA,就可以進(jìn)行基因芯片檢測(cè)。百傲公司的擴(kuò)增液就是依據(jù)PCR擴(kuò)增原理制造的。針對(duì)各待檢基因序列的SNP位點(diǎn),設(shè)計(jì)20bp左右的上、下游引物用于擴(kuò)增靶DNA,另外在引物一端連接*,用于顯色識(shí)別。擴(kuò)增液包含了

上下游引物以及PCR反應(yīng)所需的各種試劑(如dNTP、Mgcl2、H2O、Buffer等)Taq酶另管提供。將擴(kuò)增液中加Taq酶、抽提好的靶DNA通過(guò)PCR反應(yīng)將靶DNA 片段迅速擴(kuò)大,用于雜交和顯色反應(yīng)。

四.雜交顯色原理:雜交顯色原理

雜交原理:變性后的DNA擴(kuò)增產(chǎn)物與基因芯片上探針進(jìn)行特異性雜雜交原理交,就可以知道樣本DNA序列中SNP信息,即到底是屬于野生型還是突變型,是雜合子還是純合子。基因芯片雜交反應(yīng)是通過(guò)靶DNA與探針的互補(bǔ)堿基之間形成氫鍵而恢復(fù)成原來(lái)的雙螺旋結(jié)構(gòu)原理進(jìn)行的。在雜交反應(yīng)中,序列組成、靶標(biāo)DNA分子和探針的長(zhǎng)度、雜交溫度、鹽等均會(huì)影響雜交效率和強(qiáng)度。顯色原理:采用Biotin標(biāo)記的堿性磷酸酶(AP)催化的顯色原理NBT/BCIP顯色反應(yīng)的檢測(cè)方法。首先,與檢測(cè)探針雜交的擴(kuò)增產(chǎn)物上的Biotin先與鏈親和素堿性磷酸酶復(fù)合物(Stripavitin-AP)反應(yīng),生成新的復(fù)合物:Biotin-Stripavitin-AP,后者發(fā)生如下的顯色反應(yīng):Biotin-Stripavitin-AP+BCI-P→BCI-OH+PiBCI-OH+NBT→藍(lán)紫色沉淀其中,BCIP為5溴-4氯-3吲哚磷酸;NBT為硝基四氮唑藍(lán)。我公司自主研發(fā)的一系列用于雜交和顯色的溶液(包括預(yù)雜交液、雜交緩沖液、洗液

1、洗液

2、洗液

3、抗體液和顯色液)質(zhì)量穩(wěn)定,能有效提高基因芯片雜交反應(yīng)和顯色反應(yīng),排除非特異性雜交。

五.檢測(cè)原理:檢測(cè)原理(pH7.5)

采用CCD(ChargeCoupledDevice即電荷耦合器件)原理,將芯片上的色斑經(jīng)信號(hào)放大,用BE-2.0基因圖象分析軟件(軟件登記號(hào):2002SR3064)進(jìn)行分析,給出靶基因SNP信息。

 

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