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毛細管氣相色譜是氣相色譜分離技術中的zui為重要的一種分離技術。這類型的色譜柱，柱內不裝填料，空心柱阻力小，長度可達百米。將固定液直接涂在管壁上，總的柱內壁面積較大，涂層可很薄，則組分在氣相和液相相間的傳質阻力降低，這些因素使得毛細管柱的柱效比填充柱有了很大的進步。
通常來說，一根毛細管色譜柱由兩部分組成-管身和固定相。管身一般使用熔融二氧化硅或不銹鋼作為基本材質：而固定相種類就有很多了。大部分的固定相是液體或膠狀的高分字量，具有高熱穩定性的聚合物，zui常用的是聚硅氧烷（有時誤稱為硅氧烷）和聚乙二醇，另外還有一類是小的多孔粒子組成的聚合物或沸石(例如氧化鋁、分子篩等)。
毛細管色譜柱操縱中影響分離效果的條件中，主要有以下三點，這三大條件得到有效優化后，可以讓分離效果大大進步。
1. 進樣方式。
由于毛細管色譜分析中有多種進樣方式，不同的分析目的應選擇不同的進樣方式，才能有效進步柱效。殘留分析應選擇不分流進樣或柱上進樣，純度分析則多選擇分流進樣，分流比根據被測物含量而定。但分流進樣對定量精度會有影響，分流比越大定量精度越差。
2. 載氣流量。
載氣流量要根據毛細管柱的柱長、柱徑、膜厚以及被分析物的組成等綜合因素設定。高流速固然可以進步分析效率，但有時可能會因被測物與固定相之間交換不充分而降低柱效。所以在實際的分析過程中，流速的設定應在滿足分離的條件下適當增加，以進步分析效率。
3. 柱溫控制。
柱溫是影響色譜分離和分析效率的zui重要參數，所以要根據分析目的和被測物性質，如：被測物的沸點、被測物極性、被測組分的多少，通過實驗優化得到合適的柱溫。柱溫的控制表現在初始溫度，升溫速率以及終點溫度上，只有每個階段的溫度控制好，才能進步分離的效果。
毛細管色譜柱的出現是氣相色譜發展中的一個重要的里程碑，它負氣相色譜在分離效率和分析速度兩方面都大大進步。不斷出現的新型毛細管色譜柱，也讓這門技術得到飛速發展。同時，在實際操縱中，不斷優化條件能讓分離效果事半功倍。
