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硝化細菌是一類好氧性細菌，包括亞硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂層中，在氮循環水質凈化過程中扮演著很重要的角色。

硝化細菌的存活條件：硝化細菌廣泛存在于自然環境中。其存活需要水分及氧氣，只有同時滿足水分與氧氣的供應才能存活。在泥土、沙粒、生化棉、生化球、玻璃環、陶瓷環等各種有微孔的濾材中更宜于大量繁殖。硝化細菌適宜在弱堿性的水中生活，在溫度達到25度左右時生長繁殖快。它的繁殖不遵循分離定律和自由組合定律。

有的人認為硝化細菌能夠分解糞便；有的認為可以凈化水質，中和水中的懸浮物，這些認識是不準確的，或者可以說是錯誤的，硝化細菌是生產者。

首先先說說分解有機物，這個粗重的體力勞動可不是嬌貴的硝化細菌能完成的，他是靠其它凈水細菌完成的。在水生態循環系統中，若無其它異養性細菌存在，水中將到處充斥未被細菌分解的有機物，此種自我污染的水族環境一樣使魚兒無法生存其中。因此，它們常被視為是水質自凈作用的先鋒部，其重要性并不亞于硝化細菌。這類細菌普遍存在于各種不同環境，它們幾乎*，而繁殖速度相當驚人，大部份的異營性凈水細菌，在理想的環境只需二十幾分鐘即能增殖一倍。但要是裸缸飼養，我們就要借助物理循環，把水中的剩餌或糞便吸出。

不少人去買硝化細菌，按照說明每星期按時添加，這樣做對嗎？可我要告訴大家的是，你們的做法沒錯，可你們對硝化細菌的認識產生的錯誤。菌液為澄清無味或者澄清有味則可能為硝化細菌；如果菌液呈現紅色或者紫色并有尿騷味，則為光合細菌。