藍藻又名藍綠藻（blue—green algae），是一類能進行產氧性光合作用的大型單細胞原核生物，它不具葉綠體、線粒體、高爾基體、中心體、內質網和液泡等細胞器，其細胞器是核糖體，含葉綠素a，無葉綠素b，含數種葉黃素和胡蘿卜素，還含有藻膽素（是藻紅素、藻藍素和別藻藍素的總稱）。
藍藻主要包括藍球藻、顫藻和念珠藻，能通過細胞注解分裂、群體破裂、絲狀體產生藻殖和無性生殖這四種方法進行繁殖。廣泛存在于淡水產（約75%），海產，部分存在于60-85℃溫泉，與菌、苔蘚、蕨類和裸子植物共生，鈣質巖石，介殼，土壤深層。
在一些營養豐富的水體中，有些藍藻常于夏季大量繁殖，并在水面形成一層藍綠色而有腥臭味的浮沫，稱為“水華”，大規模的藍藻爆發，被稱為“綠潮”（和海洋發生的赤潮對應），如下圖所示：
藍藻水華產生的原因
1、水體的富營養化
隨著農業的不斷發展，過量的氮和磷進入水生生態系統，導致水體的富營養化。由于部分藍藻具有固氮功能以及有機磷是藍藻生長的必要因素，所以水體的富營養化導致藻類大量繁殖，形成水華。
2、CO2濃度上升
藍藻是一種利用光能將二氧化碳轉化為生物質并產生氧氣的自養細菌，藍藻能夠固定CO2用于自身的生長發育。迄今，藍藻中有五種不同的無機碳吸收系統。所以，大氣中的CO2濃度升高，水體中溶解的CO2濃度也會隨之增加，有利于藍藻的繁殖，導致藍藻水華持續惡化。
3、氣候變暖
在水溫25-35℃時，藍藻能夠達到的生長速度，所以高溫可以多種方式促進藍藻水華的生長。
藍藻水華監測
藍藻測定方法：計數法和熒光法，計數法雖為國標方法,但是因為費時和難以作到實時的數據,難以跟蹤水體變化，因此只適合于作實驗室里的測量方法；而熒光法因為能監測水體的實時數據，因此使得藍綠藻在線監測成為可能。
禹山熒光法藍綠藻特點：量程為0-270, 000 cells/mL，支持 MODBUS協議，將實時數值轉化成RS485信號輸出。采用投入式直接測量測量方法，水下最深可達30米，可在線連續監測，實時掌控水質動態。設備帶有自動清潔刷，可消除氣泡，防止沾污，減少沾污對測量的影響，維護周期更長，并保持的穩定性。