次氯酸鈉投加系統設備運行720小時后，或機器出現嚴重的電垢時，需進行酸洗，具體酸洗時間根據機器的結垢情況確定，系統分手動酸洗和自動酸洗，酸洗步驟如下：
酸洗使用，食物中的檸檬酸：
一、手工酸洗。
(1)酸洗使用，食物中的檸檬酸，配置35L，溶液10%，配置好后備用。
(2)使設備產藥停止，確認計量泵停止工作、稀釋水電動閥關閉、稀釋水流量計流量為“0”、清洗電源運行指示燈熄滅、電解電流為“0”
(3)打開電解槽排污閥、出藥閥(手動),5分鐘后電解槽內液體排出完畢，關閉電解槽排污閥。
(4)打開酸洗閥，酸洗回酸閥，啟動酸洗泵循環30分鐘(適酸洗效果決定酸洗時間)
(5)打開沖洗出水閥，沖洗進水閥，進行沖洗，5分鐘后沖洗完畢，關閉沖洗電動閥，打開放電閥，待電解槽排空，關閉沖洗水閥酸洗結束。
(6)切換到自動控制頁，“自動產生藥物”按鈕，設備自動產生藥物配制次氯酸鈉溶液。
二、自動酸洗；
(1)向酸洗罐中加入35L清水，加入4Kg檸檬酸，配以10%左右的檸檬酸溶液，配齊后備用。
(2)自動控制畫面“自動酸洗”按鈕，使設備自動進行產藥停止—酸洗—沖洗—再產藥動作，自動計時完成。