定量PCR儀其PCR擴增原理和普通PCR儀擴增原理相同，只是PCR擴增時加入的引物是利用同位素、熒光素等進行標記，使用引物和熒光探針同時與模板特異性結合擴增。擴增的結果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號連接輸送到計算機分析處理系統(tǒng)得出量化的實時結果輸出。把這PCR儀叫做實時熒光定量PCR儀(qPCR儀)。熒光定量PCR儀有單通道，雙通道，和多通道。當只用一種熒光探針標記的時候，選用單通道，有多熒光標記的時候用多通道。單通道也可以檢測多熒光的標記的目的基因表達產物，因為一次只能檢測一種目的基因的擴增量，需多次擴增才能檢測完不同的目的基因片段的量。該儀器主要用于醫(yī)學臨床檢測，生物醫(yī)藥研發(fā)，食品行業(yè)，科研院校等機構。
(1)接通電源開關，PCR儀進入準備狀態(tài);在顯示屏上記錄了當前PCR儀的溫度和蓋子(Lid)的溫度。若PCR儀正在運行時，須按“ B ”鍵(start/stop)，才能退出運行并返回準備狀態(tài)。
(2)編寫程序段。在準備狀態(tài)下按“ C ”鍵(programs)進入編程狀態(tài)，選定一程序號，然后按“enter”鍵，進入下一程序;按 “A”(list)鍵后，選一文件號(empty program);再按“enter”鍵，進入下一程序;按“ABC”鍵，進入下一程序，用上下左右鍵號選擇一個字母(A、B、C、D、…)，然后按“enter”鍵，進入下一程序;按“name ok”鍵，完成文件命名。
(3)設定蓋子的溫度。“lid temp： ℃”，蓋子的溫度一般比變性溫度要高10℃，例如變性溫度是95℃，那么蓋子的溫度就要設定為105℃。待蓋子預熱后按“enter”鍵，進入下一程序。
(4)設定變性溫度、變性時間、延伸溫度、延伸時間、退火溫度、退火時間及循環(huán)總數(shù)等參數(shù)。從*步依次按“enter”鍵進入，用四個移位鍵移動設定位置。先設定溫度，后設定時間，全部參數(shù)設置完后，按“pgm ok”鍵，所設定的程序自動被保存。
(5)運行程序。檢查設定是否正確， 按“start”鍵，選擇設定好的程序，開始運行。顯示屏上可觀察到系統(tǒng)運行的情況，按“Stop”可停止運行。
