一、垃圾的組分和粒度

許多大型垃圾處理廠的實際運行數據證明了有機廢物的組分強烈地影響著厭氧消化過程的性能。有機廢物粒度的減少對厭氧消化過程的影響：顆粒粒度減小能引起比表面積增大。一方面可以提高纖維素的可生化性，加大產氣量，使垃圾的減量化程度提高；另一方面可以減少有機廢物消化的時間。廚房垃圾的顆粒粒度對基質利用率的影響研究結果表明：當廚房垃圾顆粒尺寸由1.02mm增加到2.14mm的時候，基質的利用率由0.0033h^-1降到了0.015h^-1。這證明了顆粒粒度在廚房垃圾的厭氧消化過程中是一個重要的影響因素。

二、pH值

pH強烈地影響酶的活性，大多數產甲烷菌適合的pH范圍在6.7-7.4之間，當pH低于6.3或高于7.8，產甲烷效率會明顯下降。pH低于6.3時產甲烷效率明顯下降是由于此時甲烷的形成速率低于有機酸的形成速率，pH高于78時產甲烷效率的明顯下降是由于NH轉變成了有毒的、非離子化形式的NH3。由于pH能夠及時、快速地反映厭氧反應器的性狀，比如當反應器不充分攪拌產生問題時，pH會在揮發酸增加以前發生大幅度地變化，所以在垃圾處理廠的實際運行中也是通過pH的日常監測來判斷厭氧消化是否正常進行。

三、揮發酸VFA

大量的研究主要集中在VFA濃度方面。高濃度的VFA能夠導致微生物失活和pH降低，導致消化的失敗。所以VFA的濃度對高效率的厭氧反應器來說是個重要的因素。

四、鹽分

由于在厭氧消化的過程中容易出現VFA的積累，導致pH值降低，因而需要加入氫氧化鈉或碳酸氫銨進行調節，這勢必向反應器中引入了大量的Na⁺。

五、含水率

含水率對甲烷發酵是至關重要的，因為微生物生長所需的營養物質必須溶解在水中才能被吸收，水分不僅有助于細菌運動，而且也影響物質在高固體表面運輸和揮發酸產率和甲烷產率之間的平衡。