溫泉是雨水滲入地下，在深處加熱后在上升到地面形式，由于溫泉蘊藏深入地底之下，是屬于高溫、高壓的條件，在長期的浸泡下會有各式各樣豐富的礦物質溶解在溫泉水中，同時也由于缺氧的環境下，所以是屬于還原性的，若在溫泉水中加入和游泳池一樣的氯制劑時，溫泉的還原性就會被破壞，而轉化成氧化性，并且溶解在溫泉中的礦物質如鐵、猛就會被氧化成有顏色的氧化鐵和氧化錳等氧化物，池水就會呈現出綠色至褐色的不雅外觀；這種由還原性轉化成氧化性再產生顏色的特點就是溫泉和游泳池水處理大的不同，而這也是日本新流行以氧化還原電位（ORP）作為真假溫泉判斷的基準。

　　溫泉的水處理方式是否保有溫泉的特性，以目前而言，一般沒有經驗的工程開發商會將溫泉以游泳池的方式處置，把溫泉當作地下水，經過一連串的曝氣、加氯、沉淀與過濾后，把溫泉凈化得和自來水一樣，溫泉池水的管理也比照游泳池一般，調整酸堿度、添加氯制劑以維護溫泉水的消毒殺菌額綠藻控制等等。

　　這種屬于氧化性程式的處理方式，已經將溫泉*的還原性和豐富的礦物質破壞殆盡，不知情的溫泉業主則會以未經處理前的溫泉泉質大作廣告包裝，這對喜好泡溫泉和注重溫泉養生的泡湯客而言正是大的欺騙和侮辱，也是正因為如此，在日本溫泉學會發表反對逆流式溫泉加氯聲明后，日本厚生勞動省也在兼顧防止退伍軍人證的傳染和保有天然溫泉特性的條件下， 在公共浴池衛生管理要領修正條文中，對氯制劑等消毒殺菌劑作出流失但書。