膜的定期清洗是防治膜污染的主要措施之一，需要清洗的準則:
(1) 裝置的產水量下降10%~15%時。
(2) 裝置的進水壓力增加10%~15%時。
(3) 裝置各段的壓力差增加15%時。
(4) 裝置的鹽透過率增加50%時。
(5)裝置運行3~4個月時。
(6)裝置長期停運時，在用保護之前。
出現上述情況之一時，應進行化學清洗。
除去污染物的技術
(1)機械清洗:包括正向滲透、高速水沖洗、海綿球清洗、刷洗、超聲清洗、空氣噴射等。
(2)化學清洗:包括用酸、堿、螯合劑、消毒劑、酶、表面活性劑等。
(3)組合清洗:機械清洗與化學清洗結合。
(4)化學清洗常用試劑如下。
I)酸:有 HCI、H₂SO₄、H₃PO₄、檸檬酸、草酸等。酸對CaCO₃、Ca₃(PO₄)?、Fe₂O₃、Mn_nS_m等有效，對SiO₂、MeSiO₃有機污染物等無效。其中檸檬酸常用，其缺點是與Fe²⁺形成難溶化合物，可用氨水調節pH=4，使Fe²⁺形成易溶的鐵銨檸檬酸鹽來解決。
2)堿:有PO₄^3-、CO₃^2-和OH^-等，對污染物有松弛、乳化和分散作用，與表面活性劑共同作用去除油脂、污物和生物物質;另外對SiO₃^2-也有一定效果。
3)整合劑:的為EDTA，與Ca²⁺、Mg²⁺、Ba²⁺、Fe³⁺等形成易格的絡合物，故對堿土金屬的硫酸鹽很有效。其他整合劑有磷羧酸、葡萄糖酸檸檬酸和聚合物基螯合劑等。
4)表面活性劑:降低膜的表面張力，起潤濕、增溶、分散和去污作用,的為非離子表面活性劑，如 Triton X-100。但應注意目前復合膜與Triton X-100不相容。
5)酶:蛋白酶等，有利于有機物的分解。
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