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PCR實驗循環(huán)步驟分述

2023-10-8  閱讀(604)

      聚合酶鏈反應(PCR)技術是在體外進行的由引物介導的酶促DNA擴增反應。PCR的原理是在模板DNA、PCR引物、四種脫氧核糖核苷酸(dNTP)及適當濃度的Mg2+存在的條件下,依賴于DNA聚合酶的體外酶促合成反應。根據(jù)PCR使用說明進行試劑混合預配,并設置 PCR 循環(huán)。簡而言之,PCR需要經(jīng)過以下循環(huán):

1. 初始化步驟

這僅對熱啟動 PCR 必不ke少。此步驟將溶液加熱至 94-98°C,以激活 DNA 聚合酶。該步驟的時間取決于所使用的聚合酶。

2. 變性步驟

DNA是雙鏈分子,DNA擴增需要引物與單鏈DNA模板相互作用。在此步驟中,將反應混合物加熱至 94-98°C 并保持 20-30 秒,以破壞兩條鏈之間的氫鍵并生成單鏈 DNA 分子。此時進入 PCR 循環(huán)。

3. 退火步驟

變性后,反應混合物中的 DNA 模板是單鏈的。由于引物與DNA模板互補,當反應溫度降低到50-65℃時,引物會與模板序列匹配,互補堿基之間形成氫鍵。退火溫度取決于所用引物的Tm,一般比引物Tm低3-5℃左右。該步驟將持續(xù)約 20-40 秒以wan全退火,然后聚合酶將定位到引物-模板雜交體以開始 DNA 組裝。

4. 伸長步驟

在此步驟中,DNA 聚合酶開始合成 DNA,因此溫度應為 DNA 聚合酶的最適溫度。一般選擇 72°C,但有些酶在 68°C 時效果更好。這一步與體內(nèi)DNA復制非常相似,DNA聚合酶將dNTPs添加到引物中,以5'到3'方向與模板互補,最終產(chǎn)生新的雙鏈DNA片段。延伸時間取決于目標 DNA 片段的長度和 DNA 聚合酶的能力。一般來說,DNA 聚合酶每 60 秒產(chǎn)生一千個堿基。

5. 2~4步稱為一個循環(huán),每循環(huán)一次,目標片段量翻倍。一個 PCR 過程使用 30-35 個循環(huán)。在 PCR 循環(huán)的早期,PCR 產(chǎn)物以指數(shù)速率積累,而在 PCR 循環(huán)的后期,隨著 dNTPs、引物的減少和 DNA 聚合酶在變性溫度下的失活,反應減慢,PCR 速率逐漸下降。

6.最終伸長率。30-35個循環(huán)結束后,在68-74℃的溫度下最終延伸約5-10分鐘,以充分延伸剩余的單鏈DNA。

7.貯存。最終產(chǎn)品可以在 PCR 機器中維持溫度在 4-10°C。




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