活性污泥培養完成后，新的農村污水處理設備可以進行調試，整個污水處理廠可以按照設計的工藝流程運行。這一階段的關鍵是測試活性污泥處理系統。一方面，測試活性污泥和活性污泥處理系統的穩定性；一方面，通過試運行控制，分析和解決存在的問題，確保污水處理廠在正式運行時能夠滿足設計和相關規定的要求；此外，通過試運行，對各種處理參數進行探索、優化、改進和記錄，為今后污水處理廠的正式運行提供參考。
調試期間的巡視檢查：
試運行期間，安排技術人員定期走訪各處理單元，逐一觀察，了解處理系統的表面狀況。主要觀察結果如下：
1.顏色和氣味活性污泥的表面顏色通常可以反映活性污泥中微生物的生長和供氧情況。污水處理廠的活性污泥一般呈黃褐色，略帶土腥味。當曝氣池供氧不足時，厭氧微生物的代謝活動加強，導致污泥變黑發臭。當曝氣池供氧過多或水量過少，負荷過低時，污泥中的微生物會因自身氧化而變輕。
2.新型農村污水處理設備二沉池及污泥性能觀察。定期觀察二沉池的運行狀態，可以判斷好氧活性污泥的性質。二沉池的污泥表面狀況與好氧處理系統的正常運行密切相關。二沉池檢查時，泥面高度、上清液透明度、有無浮泥、浮泥粒徑等。主要是觀察。
上清液清澈透明，運行正常，污泥性質良好；上清液濁度說明負荷過高，活性污泥氧化分解有機物不；上升的污泥表面和較高的SVI表明污泥膨脹和沉降性能較差；污泥層層上浮，說明污泥中毒；污泥的細漂說明污泥的絮凝是由于水溫過高、曝氣過度、C/N比不合適、營養不足等原因造成的。
3.曝氣池和污泥性質的觀察通過對曝氣池的觀察，可以判斷污泥的顏色、氣味和絮凝情況；觀察液位波動，判斷曝氣是否均勻；觀察液位泡沫，判斷系統工作是否正常。當泡沫小、易碎、粘度低、呈乳白色時，說明新農村污水處理設備系統運行正常；當泡沫量增加時，不容易破裂，粘度高，顏色變化，系統可能無法正常工作。
