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江蘇菲亞生物科技有限公司
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公司信息
微藻基因組提取的方法概述
2017-3-9 閱讀(997)
微藻基因組提取的方法主要有以下幾種：
1、采用CTAB法
2、收集藻體
3、液氮研磨
4、加入CTAB提取液
5、苯酚抽提、乙醇沉淀
6、洗滌
一般來說，液氮研磨是的方法。原因如下：
1、液氮冷凍使得藻體變脆，易于破碎。
2、液氮研磨的力度，一般不會對基因組DNA造成機械損傷。
3、在低溫下，各種酶包括核酸酶的活性較低，可以zui大程度防止核酸的降解，這點在制備RNA的時候，尤為重要。所以，在制備微藻基因組時，應該盡量用液氮研磨。
當然，用液氮往往比較麻煩；并且有潛在的危險，所以在某些情況下，也可以用一些替代性的方法，主要分為三類：
*類、常溫研磨。即用玻璃勻漿器或者組織勻漿機來破碎細胞，但需要做一些與實驗來確定研磨的時間/力度。
第二類、酶解。即用針對于研究對象細胞壁成分的酶，來酶解細胞壁，進而達到破碎細胞的目的。常用的酶有果膠酶、纖維素酶、半纖維素酶、溶菌酶、海螺酶、蝸牛酶以及DRISELASW 崩潰酶，同樣需要做預試驗確定酶的種類和用量，以及酶解時間。
第三類、使用強的裂解液。例如異硫氰酸胍等，經過長時間浸泡，可以“溶解”藻細胞。
