(1)生物吸附法生物吸附法是指污染物與生物細胞及細胞膜吸附等的生物化學反應，其主要的生物吸附劑主要是農作物、藻類等，此法的吸附劑與物理吸附法一樣也可以采取一些方法將其的吸附量適當提高，調節溫度、pH值等都可將其吸附量改變，此法方便、成本低且吸附量大，是一個比較實用的方法。
(2)植物修復法植物修復法是利用根部發達的植物對污染物吸收從而達到清除目的，主要的植物有水葫蘆、藻類等，此法環保還可清除土壤中的污染物，但也存在季節問題且植物生長方向不好控制，如水葫蘆。
(3)微生物絮凝法微生物絮凝法主要利用的是微生物，污染物與其代謝產物(蛋白質、多糖等)發生絮凝從而達到清除目的。此法目前還處于科研階段，但其、環保、無二次污染，是值得大家研究的一個方法。
實際上，制藥工業廢水自身具有顯著的特點，若僅采用傳統工業廢水處理的方法既不能保證處理的效果，也不符合制藥企業的要求，且處理成本高，清除效率差，的浪費人力和物力。目前，我國還沒有制訂專門針對制藥廢水處理的標準和體系，導致各藥企僅按普通工業廢水的標準進行處理，這一現象十分普遍，且還未見有較好的解決方法。希望各藥企和部門共同努力，積極配合，全面研發，早日完善制藥工業廢水處理的標準，提高我國制藥工業廢水處理的效率，降低排放，保護生態環境。
