小分子抗原現在做的zui多的是農yao和獸藥，這方面的文獻也很多。以前查過一些材料，作者覺得小分子抗原能否制備出高性能的單克隆抗體主要以下幾點決定。
1、對于半抗原結構的選擇，如果待測物本身含有NH2，COOH，OH等活性基團，可以利用待測物活性基團加入間隔臂，然后聯入載體蛋白就可以成功合成人工抗原，制備特異性良好的抗體。
但大部分待測物上并不含有活性基團或活性基團對藥物的特異性和極性影響很大，所以大部分用于人工抗原合成的半抗原要經過改造或從頭合成。例如在關于有機磷農yao倍硫磷的免疫檢測方法的研究中，半抗原物的獲得采用的合成方法并不是從倍硫磷開始合成，而是采用另一途徑，從起始物重新合成，這樣反而能取得較好的效果，這一點對于制備具有多殘留檢測能力的抗體來說更為重要，只需合成出幾種待測藥物共有的結構就有可能制備出具有多殘留檢測能力的抗體。（Yoo Jung Kima，2003）
2、待測物本身的結構有時對建立方法的性能有很重要的影響，在分子量在111－1202Da的化合物制備的單克隆抗體的親和系數的試驗中，半抗原的分子量在334–374Da之間時，制備的單克隆抗體具有很高的親和系數。但當要檢測的小分子化合物的分子量小于300Da時，產生具有良好靈敏度和特異性單克隆抗體的可能性下降（Chappey et al.，1994）。這說明藥物的分子量是影響抗體性能的重要因素。同時待測物的結構對于制備人工抗原的難易程度有重要影響，有些半抗原經過理論分析能制備出高質量的抗體，但從化學合成的角度，這些化合物可能是合成不出來的或工藝過于復雜，所以半抗原結構能否合成出來，也是半抗原結構設計過程中要考慮的問題。
3、如果待測物結構過于簡單，可能也是不能建立免疫檢測方法的。待測物的結構含有特征性的環(huán)狀結構或側鏈結構，甚至含有雜原子，都能夠增加制備出高質量抗體的可能性。在對脂肪酸類物質制備抗體的試驗中，對于脂肪酸類物質來說，如果含有兩個以上的羰基，及與蛋白偶聯之后還有多余的羰基增強親水性，同時酰基的不飽和雙鍵和極性的頭部結構都可以做為B細胞的抗原決定簇，可以將其他抗原性很弱的部分變成強抗原性。再者如果脂肪酸含有平面結構，也可以作為抗原決定表位，使產生特異性的抗體。這說明小分子的極性以及不飽和鍵，苯環(huán)結構都可以增強抗原性，簡單的直鏈結構很難產生特異性很強的抗體，這也是一般選用直鏈作為間隔臂的原因。直鏈碳鏈本身的抗原決定性很差，不會產生針對間隔臂的抗體。
4、合成人工抗原的過程中，即使半抗原絕大部分的官能團與待測物都是一致的，它也可能在聯入蛋白載體的過程中受到屏蔽作用。小分子藥物在與載體蛋白連接的部位很容易受到屏蔽。從而產生的抗體就會喪失對那些屏蔽基團的特異性。確定半抗原不受蛋白的屏蔽作用在人工抗原合成中非常重要，解決這一問題的*方法就是聯入間隔臂。
5、間隔臂的連接位點的選擇對于抗體質量至關重要，不要影響小分子化合物中特征性的基團暴露于免疫B細胞的抗原表位，這也是待測物本身的羧基，氨基一般不能直接聯入間隔臂，因為這些基團對小分子藥物的電性和極性影響非常大。而且引入的間隔臂不能影響主要基團的電子分布，例如苯環(huán)和其他雜環(huán)類的電子分布，這就要求間隔臂的極性和能量要低，將對小分子藥物的電子排布和空間結構的影響降到zui低，從這個角度來說，低能量的直鏈間隔臂是*的選擇。聯入間隔臂的半抗原的電子分布與目標待測物的電子特性一致性對抗體針對待測物的特異性至關重要。
6、半抗原間隔臂的連接位點，選擇極性較低且遠離半抗原的特征性結構。如果待測物的極性較高，半抗原合成的過程中保持其與目標待測物極性的一致性。人工抗原具有較高的極性，對于引發(fā)免疫反應有重要作用。在結構3Bentazon的抗體制備過程中，有三個介入位點。異丙基遠離雜環(huán)，是聯入間隔臂的理想位點，可以zui小程度的改變待測物的物理和化學特性。但異丙基是這物質的特異性基團，對于保證制備抗體的特異性很重要，所以不能選擇這個位點。
7、Bentason II位的亞氨基具有很強的極性，如果間隔臂聯入這個位點極性將會消失。這種化合物的衍生物大多為非極性，如果要制備多殘留的抗體，增加交叉反應率，這個位點將是理想的間隔臂介入位點。但對特異性要求高的抗體制備，就必須要保證半抗原的極性，所以對于高特異性的抗體制備來說，這一位點也不適合連入間隔臂。在 III位介入直鏈的間隔臂，可以保證與待測物極性的一致，而且中性的多甲基直鏈對雜環(huán)的電子排布影響也較小。試驗結果顯示II，III聯入間隔臂制備的抗體對Bentason的靈敏度很差，但是對II位氨基衍生的樣品的靈敏度高于目標待測物，說明衍生物的非極性是靈敏度高于原形Bentason的原因。這也與MQCA抗體對原型藥物識別能力較差，但對丁胺衍生后的樣品具有高靈敏度的實驗結果相一致。說明半抗原與待測藥物電荷狀態(tài)的一致性，在這些極性很強的藥物小分子免疫殘留檢測方法中要重點考慮。但III位接入間隔臂的人工抗原制備的抗體的靈敏度與預期不一致，這可能因為再III位聯入間隔臂時，間隔臂上面自由的羧酸基團可能與II位自由的氨基發(fā)生偶聯，所以III位聯入間隔臂的人工抗原的極性與目標待測物不一致，這也是抗體對目標待測物識別能力較差的原因。

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