上海滬宇科學家們一直致力于在基因組中尋找與癌癥有關的遺傳學改變。在此基礎上，人們對癌癥的理解以及癌癥治療都取得了巨大的進展。

這類研究大多關注基因組的編碼區域，但這一區域只占到人類DNA的2%，應該還有大量癌癥相關突變發生在非編碼DNA上。非編碼DNA曾被稱為“垃圾DNA”，雖然人們早已知道它們其實并不是垃圾（許多轉錄為RNA），但解析這些序列的功能并不容易。

研究人員在卵巢癌、乳腺癌等12種癌癥中，建立了將近14,000個長非編碼RNA（lncRNA）的DNA拷貝數圖譜。卵巢癌和乳腺癌是兩個主要的BRCA相關癌癥。隨后，他們以臨床、遺傳學和基因表達數據為基礎進行過濾，剔除了與癌癥無關的拷貝數改變，系統地研究了剩下的37個 lncRNA。

研究顯示，1號染色體上的FAL1（focally amplified lncRNA）就是一個RNA癌基因。迄今為止，只有少數lncRNA與癌癥關聯起來。研究人員給免疫功能低下的小鼠引入人類卵巢腫瘤，然后注入siRNA對FAL1進行RNA干擾，這一措施成功使腫瘤出現了萎縮。

個性化診斷

FAL1在卵巢癌和乳腺癌中存在過表達，通過RNAi阻斷該基因的活性，能減少癌細胞的生長。另一方面，這個基因的過表達會促進細胞的生長。研究人員在人卵巢癌樣本中進行分析，發現FAL1的高表達與預后差有關。

為了鑒定FAL1的功能，研究人員找到了與FAL1 RNA有關的蛋白BMI1。BMI1是基因調控復合體PRC1中的一員，能下調數百個基因的表達，其中就包括編碼腫瘤抑制蛋白p21的基因。研究顯示，FAL1缺失會使BMI1蛋白變得不穩定。

研究指出，卵巢癌中的FAL1擴增使FAL1 RNA過量，增強了BMI1蛋白的穩定性，下調了p21，并zui終導致細胞生長脫離控制。FAL1的表達可以作為生物學指標，幫助人們預測BRCA相關癌癥的預后情況。另外，人們也可以開發小分子藥物，特異性靶標FAL1 RNA或者阻斷FAL1-BMI1相互作用，對相關癌癥進行治療。