多克隆抗體（多抗）能識(shí)別任一抗原上的多個(gè)表位，而單克隆抗體（單抗）僅檢測(cè)任一抗原上的一個(gè)表位。

多克隆抗體的優(yōu)點(diǎn)：

1. 多克隆抗體可有助于放大低表達(dá)水平的靶蛋白信號(hào)，因?yàn)榘械鞍卓稍诙鄠€(gè)表位上結(jié)合不止一個(gè)抗體分子。但是這會(huì)給定量實(shí)驗(yàn)造成不利影響，因?yàn)榻Y(jié)果將變得不準(zhǔn)確

2. 比單克隆抗體更能容許抗原中的微小變化。

3. 由于能識(shí)別多個(gè)表位，多克隆抗體可在IP/ChIP中得到更好的結(jié)果。

4. 它們會(huì)識(shí)別出與免疫原蛋白質(zhì)具有高同源性的蛋白質(zhì)，或者從非免疫原物種的組織樣品中篩選靶蛋白，例如當(dāng)未測(cè)試物種中的抗原性質(zhì)未知時(shí)，有時(shí)會(huì)使用多克隆抗體。這也使得檢測(cè)免疫原序列以確定是否有任何交叉反應(yīng)性非常重要。

5. 多表位通常可提供更為有力的檢測(cè)。

6. 多克隆抗體通常是檢測(cè)變性蛋白質(zhì)的。

7. 多克隆抗體不適用于探測(cè)抗原的特定結(jié)構(gòu)域，因?yàn)榭寡逋ǔ？勺R(shí)別多個(gè)結(jié)構(gòu)域。
不足之處：

1·易于產(chǎn)生批次間差異。

2·產(chǎn)生大量非特異性抗體，有時(shí)可能在某些應(yīng)用中產(chǎn)生背景信號(hào)。

3·多表位使得檢測(cè)免疫原序列以確定是否有任何交叉反應(yīng)性非常重要。

客觀事實(shí)：

1. 識(shí)別任一抗原上的多個(gè)表位。獲得的血清將包含不同親和力抗體的異質(zhì)復(fù)合體混合物。

2. 多克隆抗體主要由 IgG 亞類組成。

3. 肽免疫原通常用于產(chǎn)生靶向*表位的多克隆抗體，特別適合高同源性的蛋白家族。

抗體制備：

1. 制備所需技術(shù)和技能不高。

2. 制備時(shí)間短。

3. 多克隆抗體不適用于探測(cè)抗原的特定結(jié)構(gòu)域，因?yàn)槎嗫寺】寡逋ǔ？勺R(shí)別多個(gè)結(jié)構(gòu)域。
單克隆抗體優(yōu)點(diǎn)：

1. 雜交瘤制得后，就成為了恒定的再生源，所有批次都將相同–對(duì)確保實(shí)驗(yàn)步驟和結(jié)果的一致性和標(biāo)準(zhǔn)化非常有幫助。

2. 單克隆抗體通常在切片和細(xì)胞染色造成的背景較低。因?yàn)樗鼈円愿鼜?qiáng)特異性檢測(cè)一個(gè)靶表位，所以不太可能與其它蛋白質(zhì)發(fā)生交叉反應(yīng)。

3. 與多克隆抗體相比，單克隆抗體的同質(zhì)性非常高。如果實(shí)驗(yàn)條件保持不變，單克隆抗體的各實(shí)驗(yàn)結(jié)果重現(xiàn)性很高。

4. 由于具有特異性，單克隆抗體非常適于用作分析測(cè)定中的一抗，或者用于檢測(cè)組織中的抗原，并且通常所產(chǎn)生的背景染色顯著低于多克隆抗體。

5. 單克隆抗體的特異性能使其在混合物中和抗原地結(jié)合。
不足之處：

1·可產(chǎn)生大量特異性抗體，但是可能特異性過(guò)強(qiáng)。

2·經(jīng)過(guò)抗原的化學(xué)處理后比多克隆抗體更易于丟失表位。這可通過(guò)使用同一抗原的兩個(gè)或多個(gè)單克隆抗體進(jìn)行補(bǔ)償。

客觀事實(shí)：

1. 僅檢測(cè)抗原上的一個(gè)表位。

2. 它們僅由一個(gè)抗體亞型組成。在需要二抗進(jìn)行檢測(cè)時(shí)，應(yīng)針對(duì)正確的亞類選擇抗體。

抗體制備：

1. 需要高技術(shù)。

2. 需要先培訓(xùn)才能使用技術(shù)。

3. 制備雜交瘤耗時(shí)長(zhǎng)。