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上海交大《JACS》發(fā)表生物交叉學(xué)科成果

時間:2011-7-22閱讀:708
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日,來自上海交大生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院、美國弗萊德•哈欽森癌癥研究中心的研究人員在在A型流感病毒M2跨膜蛋白質(zhì)子通道分子調(diào)控機制的研究中取得重要進展,成果發(fā)表在化學(xué)領(lǐng)域?qū)W術(shù)期刊《美國化學(xué)會志》(Journal of the American Chemical Society)上。

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文章的*作者是上海交大生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院的博士生顧若虛,上海交大的魏冬青教授及美國弗萊德•哈欽森癌癥研究中心的Limin Angela Liu為這篇文章的共同通訊作者。魏冬青教授的主要的研究方向為生物信息學(xué)和生物物理學(xué),近年來主要開展結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)和計算機輔助藥物設(shè)計的研究工作。至今發(fā)表SCI文章100多篇,累積引用2422次。

2008年《自然》(《Nature》)雜志曾同時發(fā)表了兩篇文章,報道了A型流感病毒M2跨膜蛋白質(zhì)子通道的結(jié)構(gòu),分別由X-ray和NMR獲得,但是配體結(jié)合位點則*不同,一個在通道中間(P-binding site), 而另外一個在通道表面靠近C端的位置(S-binding site),這引發(fā)了諸多的科學(xué)爭議。

顧若虛博士在魏冬青教授的指導(dǎo)下采用分子動力學(xué)和自由能計算的方法計算了通道的抑制劑金剛乙胺結(jié)合到離子通道兩個位點處的自由能,發(fā)現(xiàn)通道中間的結(jié)合位點比通道表面的結(jié)合位點從能量上更加穩(wěn)定,但需要跨越的能壘遠遠高于結(jié)合到通道表面的位點,因此,通道中間的結(jié)合位點是熱力學(xué)位點,對抑制通道起主要作用。通道表面的結(jié)合位點是動力學(xué)位點,藥物更容易結(jié)合,同時也更容易解離。這項研究工作解釋了上述看似相互矛盾的實驗現(xiàn)象,同時有助于闡釋藥物調(diào)控離子通道的機理,對于藥物設(shè)計有一定的指導(dǎo)作用。

來源:生物通

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