自從1962年科學家們首先在水母體內發(fā)現(xiàn)綠色熒光蛋白（GFP）以來，這種神奇的蛋白質技術獲得飛速地發(fā)展，成為了生物學功能研究的重要工具之一。除了水母中的綠色熒光蛋白，研究人員還從其他的動物體內分離獲得了多種GFP樣的熒光蛋白。在過去的十年里各種不同光譜的熒光蛋白不斷地被發(fā)現(xiàn)，受到啟發(fā)的研究人員一直期待著開發(fā)出一種工具能夠對生物功能進行直接的顯像研究。

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單體熒光蛋白
目前單體熒光蛋白被廣泛應用于確定蛋白質定位和豐度，進而追蹤細胞過程例如膜脂形成、細胞形狀改變和組裝和移動。此外，還可用作單鏈的成分或作為熒光共振能量轉移（FRET）的供受體以及作為單細胞的填充物。

復合熒光蛋白
某些復合熒光蛋白比同樣顏色的單體熒光蛋白要明亮得多，因而可用于報告基因表達和標記細胞，常被優(yōu)先用于優(yōu)化信噪比。主要應用是填充和追蹤細胞。2007年科學家們利用多個復合和單體熒光蛋白“標記”了小鼠大腦中上百個細胞，一個個拖著長長神經纖維的神經細胞就像一個個五顏六色的風箏，整齊排布或者彼此相交。科學家們將小鼠命名為“Brainbow”（彩虹）小鼠。

可逆開關型熒光蛋白
某些熒光蛋白在光照下發(fā)光基團的構象會發(fā)生改變，自發(fā)逆轉導致熒光亮度增高或降低，在某些情況下，當一種特殊的吸收峰形成時，新波長的光可加速這種逆轉。這些蛋白常被作為探針用于基于單分子的超分辨顯微檢測中。

不可逆開關型熒光蛋白
某些熒光蛋白在光照下可發(fā)生結構的共價改變，從而在特異的波長下發(fā)光。其主要應用包括連接性追蹤、蛋白擴散和超分辨顯微檢測

多成分感受器
不同于單一感受器用于檢測蛋白質定位或豐度，復雜的報告系統(tǒng)是利用各種顏色的熒光蛋白同時標記多種蛋白質構建形成。例如日本RIKEN腦研究的科學家，利用熒光泛素化為基礎的細胞周期指示劑和雙色熒光探針，可以進行活體細胞周期定位分析，稱為Fucci。此外還有一種特異的RNA標記物能夠同時招募微弱互補的熒光片段與序列特異性的RNA結合蛋白相融合。這些自發(fā)互補的GFP片段在不同的細胞表達從而揭示細胞與細胞間的相互作用。

生色團調控感受器
在生色團調控感受器中，非共價鍵結構改變可影響單個熒光蛋白域的熒光性。而pH和氧化還原感受器，則是通過發(fā)光團或熒光蛋白β-桶裝區(qū)的氨基酸進行傳感。其他的感受器則是依靠從傳感區(qū)到融合熒光蛋白區(qū)的構象改變進行傳遞。在大多數(shù)情況下，熒光改變都是由于發(fā)光團質子效應改變所致。例如lumenal pHluorin感受器可用于分析突觸小泡的胞吐作用。

FRET感受器
適用于各種信號和蛋白的FRET熒光蛋白感受器常被設計用于檢測信號誘導構象改變，這些構象改變可以影響熒光蛋白間的熒光共振能量轉移。例如磷酸化可以改變融合在末端的熒光蛋白的距離或定向，從而改變熒光共振能量轉移。此外兩種蛋白還可以信號依賴的方式相互作用，從而使得融合熒光蛋白間的熒光共振能量轉移增強。這些設計適用于各種信號，例如用于檢測激酶活性、組蛋白甲基化以及細胞內Ca2+和*。來源：生物通