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鑒定與疾病相關聯的蛋白難度頗高,因為樣品中的少數幾種高豐度蛋白在總蛋白中占了很大的比例。以臨床研究中常用的血清和血漿為例,蛋白濃度范圍跨越了11個數量級。而且,20種zui高豐度的蛋白占據了總蛋白量的97-99%。如此一來,有價值的生物標志物就變得難以尋覓了。
如何打倒高豐度蛋白這個巨人,發現其身后躲藏的低豐度蛋白呢?Bio-Rad公司開發出ProteoMiner蛋白富集技術,能夠降低高豐度蛋白的水平,助您發現低豐度蛋白的秘密。關于此項技術,生物通之前曾做過詳細報道,請看《揭開低豐度蛋白的秘密》這篇文章。如今,這項技術已經走向,應用在多個蛋白質組學實驗室中。這一次,Bio-Rad公司請來三位蛋白質組學方面的專家,談談他們是如何應用ProteoMiner技術的。
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Stefan Lehr博士(德國)——發現糖尿病診斷的生物標志物
德國糖尿病中心30多年來一直將的技術、研究行動與病人關懷融合,以求闡明疾病的方方面面。他們的目標是:了解疾病的生理機制,減少糖尿病相關的并發癥,并改善患者的治療。
正是這種從基礎研究到臨床應用的轉化,吸引了Stefan Lehr博士在獲得博士學位之后加入了該中心。Lehr的研究生階段是在科隆大學度過的,他的研究方向是信號轉導和胰島素受體的磷酸化。經過多年的鍛煉,他對質譜、2-D電泳以及亞細胞分部等復雜的實驗室技術非常精通。Lehr認識到II型糖尿病是一種發病率逐年提高的疾病,于是他建立了一個蛋白質組學實驗室。
如今,Lehr仍然在使用技術來分析與II型糖尿病相關的蛋白模式。研究的一個方面是分析人類血清樣本,以了解疾病的分子發病機理。在使用2-D差異凝膠電泳時,他面臨的干擾也是高豐度蛋白。“大的斑點遮蔽了小的斑點。傳統方法需要好幾步,有時可能會丟失蛋白,”Lehr認為。
這個挑戰激發了Lehr對Bio-Rad ProteoMiner蛋白富集技術的興趣。之后,Lehr就開始用人類血清來檢驗這項技術。初期檢測表明人類血清也能進行蛋白質圖譜分析。隨后,研究小組設計實驗,來評估重復性和變異性,以及與下游方法的兼容性。Lehr強調關鍵是在重復性。
隨著驗證實驗的成功完成,Lehr計劃將ProteoMiner蛋白富集技術融入他的流程之中,作為低豐度蛋白的一步分部法。他希望由此鑒定出II型糖尿病早期階段的生物標志物。糖尿病的診斷通常是在發作幾年后。Lehr希望疾病的早期診斷能夠預防相關的并發癥,比如心肌梗塞和中風,并顯著降低治療的費用。來源:生物通
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