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基因化石揭示人類進化史

閱讀:758發布時間:2011-3-9

     “跳躍基因”(jumping genes)一詞指的是基因編碼的物理交換過程中基因信息在物種間的交換。人類也不可避免的受到一些疾病基因編碼的侵襲,在人類漫長的進化歷史中始終伴隨著某些疾病所帶來的危害,比如癌癥。

   

 

 


       逆轉錄病毒感染在動物的進化歷史長河中已經存在了上百萬年。在有些情況下,寄生的基因會融入到宿主的種系中,這就是內源性逆轉錄病毒。你可以把其理解為保存在基因中的“化石”,人類基因中高達8%是由這些“化石”所組成。在經過數百萬年的基因變化,大部分內源性逆轉錄病毒是保持休眠狀態;但有些仍然會發揮其基因編碼的作用,它們的作用有好有壞,有些能調節宿主的免疫 反應,有些則會促使疾病的發生,如多發性硬化和某些類型的癌癥。但在目前,年代超過2.5億年前的逆轉錄病毒序列不能在今天的基因組中被發現。文章作者比較了兩種計算方法:基本的系統發育方法(basic phylogenetic method)和需要密集計算的蒙特卡羅馬爾科夫鏈(Monte Carlo Markov Chain,MCMC)方法,研究者發現這兩種方法對于小于4000萬年的內源性逆轉錄基因的預測都比較相近。而大于4000萬年的結果則出現了明顯分 歧,年代久遠,分歧越大。 兩種方法各有優劣,當數據量大的時候MCMC方法的計算會非常耗時。對于全基因組研究來說,在保證計算可行性和準確性的時候,簡單的系統發育方法則是一個較好的選擇。
 


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