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中科院杰青研究組文章解析DNA分析新方法

閱讀:626發布時間:2011-3-14

來自中科院動物研究所,武漢大學的研究人員建立了一個測定Kf的等溫差異雜交方法,為了解生理條件下G-四重折疊形成提供一個有用的工具。這一研究成果公布在Anal. Chem.雜志上。
  領導這一研究的是動物研究所譚錚研究員,這位研究人員回國后曾在華南理工大學,武漢大學等多處任職,2005年加入中科院動物研究所,曾獲得國家杰出青年科學基金,入選*"百人計劃"國外引進杰出人才,其課題組主要研究方向是衰老的分子生物學研究。
  人端粒DNA和其他很多富*(G)序列能形成一類稱作*-四重折疊(G-quadruplex)的DNA四重折疊結構。這種結構與很多生物學過程、治療癌癥以及分子機器有關。折疊平衡常數Kf是衡量G-四重折疊形成能力的定量描述。生理條件下的G-四重折疊結構不是獨立存在,而是伴有旁側結構或與蛋白結合。然而現有的Kf測定方法只能用于核心序列。
  在這篇文章中,譚錚研究組建立了一個測定Kf的等溫差異雜交方法,不僅能用于核心序列,同時適用于伴有旁側結構或結合蛋白存在的情況這一方法將為了解生理條件下G-四重折疊形成提供一個有用的工具。
  近期有關DNA研究也獲得了許多重要成果,讓人印象深刻的就是來自愛荷華大學的研究人員發現當一種特殊的DNA重復片段——Alu元件插入到基因中,可以改變蛋白質生成的速率,從而導致了不同物種中不同生物學特性的進化。
  Alu元件大約是在6000萬年前隨靈長動物的進化而出現的一種特殊的DNA重復序列。其他的哺乳動物基因組中不存在有Alu元件。在人類基因組中Alu元件是zui常見的一種可移動DNA,并能夠跳躍至基因組序列的其他位置。當他們插入到包含基因區域時,這些元件有可能轉變為新外顯子。盡管在十幾年前科學家們就明確Alu元件是人類基因組中新外顯子的重要來源,但是一直也無法確定這些新外顯子是否真正具有重要的生物功能。
  這篇文章利用高通量RNA測序新技術分析了來自人類小腦的1.2億個RNA序列,進而對Alu衍生的外顯子插入成熟RNA序列中的頻率進行了定量,并由此確定了它們在基因中的插入位置以及zui終蛋白質生成的藍圖。
 


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