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生物物理所等在金屬蛋白設計方面取得進展

閱讀:334發布時間:2016-11-14

3月13日,《德國應用化學》雜志在線發表了*生物物理研究所王江云課題組和美國伊利諾伊大學香檳分校(University of Illinois at Urbana-Champaign)化學系陸藝教授課題組的合作研究成果:Dramatic Increase of Oxidase Activity through the Genetic Incorporation of Tyrosine-Histidine Crosslink in a Myoglobin Model of Heme-Copper Oxidase(Angew. Chem. Intl. Ed. DOI: 10.1002/anie.201108756)。該研究利用非天然氨基酸的定點插入,實現了用18kD 的肌紅蛋白模擬呼吸鏈中重要膜蛋白復合物*氧化酶。該工作提供了*氧化酶中保守翻譯后修飾Tyr-His功能的直接證據,是蛋白質設計領域的重要進展,并有望在生物能學中獲得重要應用。

*氧化酶(CcO)即呼吸鏈復合體IV是線粒體氧化呼吸的限速酶,它直接參與線粒體中氧氣的還原和質子梯度產生,它的損傷影響線粒體功能,導致大量產生活性氧。由于CcO在能量產生和調節中的重要地位,自被發現以來一直是生物研究領域中重要的研究課題。X-射線晶體結構衍射研究發現,哺乳動物或細菌中都含有經翻譯后修飾形成的Tyr-His 共價交聯,但因受技術手段的限制及缺乏直接的證據,對于共價交聯Tyr-His的確切作用目前仍是科學研究爭議的焦點。

通過人工進化的方法可以增加非天然氨基酸的新基因編碼。研究人員首先把無意密碼子“UAG”確定為新的遺傳密碼,然后對天然的組裝核糖核酸(tRNA)突變,使其含有反密碼子“CUA”。在此基礎上,從氨酰-tRNA合成酶突變庫中篩選出可專一結合這種tRNA和非天然氨基酸的氨酰-tRNA合成酶突變體。之后,將生命體中mRNA上任意一個遺傳密碼取代為UAG,并在培養基中加入化學合成的非天然氨基酸,就可以在蛋白質中相應的位置插入有特殊物理性質、化學性質的非天然氨基酸。

本研究首先篩選得到了對含有Tyr-His共價交聯特征元素的3-咪唑基*特異性識別的氨酰-tRNA合成酶,并將該非天然氨基酸插入到了模型蛋白Myoglobin中。再將Mb活性中心空穴內的氨基酸Leu29突變成His,Phe33突變為3-咪唑基*,實現了催化還原氧氣轉化為水分子,產生小于6%的活性氧,催化轉化數超過1000,催化劑未出現明顯降解。

作為對照,研究人員構建了突變體Leu29His/Phe33Tyr/Phe43His (F33YCuBMb),其中,29位、43位和64位His可以形成一個銅離子結合位點,而33Tyr和43His在Mb上的位點及結構與imiTyrCuBMb中33位imiTyr的咪唑基團及酚基團類似,但沒有形成共價交聯。相比imiTyrCuBMb,F33YCuBMb將50%的O2轉化成了ROS。這一研究結果表明了Tyr-His翻譯后修飾共價交聯的重要性。在此基礎上,研究人員將能進一步利用非天然氨基酸定點插入及定向進化提高*氧化酶模型蛋白的活性,并將其應用到生物電極中。


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