色譜柱由常規(guī)柱轉(zhuǎn)為微柱后，隨著柱內(nèi)徑的減少，液相色譜法分析呈現(xiàn)出以下一些優(yōu)點：
1 可分析極少量的樣品，特別適用于分析貴重樣品和從活體采集具有生物活性的樣品。
2 色譜柱中填充固定相的用量大大縮減，僅為常規(guī)的液相色譜儀的1%~10%，簡化了填充方法，不僅降低了分析成本，也便于選擇和更換固定相。
3 分析中流動相用量也大大減少，僅為常規(guī)的液相色譜儀的1%~10%，流動相對環(huán)境的污染減少，有利于保護環(huán)境。
4 微柱隨內(nèi)徑的減小，縮減了固定相的用量，減少了柱阻力，使輸送流動相的壓力降低，不僅可使得分析時間縮短，還大大提高了柱效，可達(dá)10萬~30萬塊/m塔板理論數(shù)。
5 通過微柱的流動相使用了很低流量，因此微柱GPLC易與質(zhì)譜或核磁共振波譜構(gòu)成聯(lián)用系統(tǒng)，也易與其他HPLC柱組成二維HPLC偶聯(lián)體系。
與上述諸多優(yōu)點相對應(yīng)，微柱液相色譜在使用發(fā)展過程，也表現(xiàn)出一些不足之處，它們也是實現(xiàn)微柱液相色譜理想分離結(jié)果所必須解決的關(guān)鍵技術(shù)問題，可歸納為：
1 微柱液相色譜喪失了常規(guī)柱具有的“無限直徑“效應(yīng)而保持高柱效的優(yōu)勢，并突出了柱外效應(yīng)對降低柱效的影響。
2 由于微柱對樣品容量的降低，使得常規(guī)液相色譜進樣技術(shù)的應(yīng)用受到限制。
3 由于進樣量的減小，樣品從微柱洗脫出的濃度很小，需使用高靈敏度檢測器進行檢測。
4 制作微柱的成本雖然降低，但制作一根高柱效、高選擇性的微柱，仍需要較高的實驗技能。
5 由于微柱的流動相僅使用每分鐘幾至幾十微升的流量，需使用高精度、穩(wěn)定性好、低流量的新型高壓。
