液相色譜儀的分離是在色譜分離柱中實現的。我們目前工作中多采用反相色譜柱，如何保護好分離柱減少柱的污染是延長柱壽命的關鍵。
1維護好色譜分離柱的方法
加保護柱（預柱）是保護分離柱的有效辦法。保護柱是根內裝填料與分離柱性質相近的短柱，接在分離柱之前，或代替流路過濾器。保護柱的作用是收集和阻塞分離柱口的化學垃圾，這些垃圾如果直接進入分離柱會逐漸堆積在柱頭，zui終降低柱效能。
避免高壓沖擊分離柱。一般色譜柱都能承受得起高壓，但經不住突然變化的高壓沖擊，這將改變柱床體積，影響柱效。
合理選擇分離柱。我們知道，選擇色譜分離柱主要根據兩點，一是根據待測組分的分子量的大小；二是根據流動相條件，包括PH值、離子強度和溶劑極性等。
定期沖洗分離柱。每次分析工作結束時，沖洗完緩沖鹽后，zui后要過度到用強溶劑沖洗柱子，如可用色譜純甲醇、乙腈沖洗反相C18柱，目的是沖去吸附在柱上的強保留組分。如果用甲醇/水為流動相也應這樣沖洗柱子，在一定程度上可恢復柱效。
2減少柱的污染的方法
zui有效的辦法是純化樣品。我們在多年的分析工作中發現，凡是樣品純化的越干凈，分離柱的壽命就越長；反之，只有提取沒有純化的樣品，分離柱柱效下降較快。建立一個理想的色譜分析方法應該有一套有效的樣品前處理方法，特別是在分析血漿和尿液樣品時，要特別注意樣品的提取與純化，盡量使處理過的樣品中雜質降到zui低，保護柱頭和柱子。
提取純化好的樣品用流動相來溶解，一方面減少色譜圖中的溶劑峰干擾，另一方面也是檢查樣品在流動相中的溶解性，如果樣品進樣后在流動相中沉淀，會堵塞進樣器和柱頭，甚至樣品分解，出現怪峰。如果出現樣品與流動相不溶要設法改變溶解條件，如更換樣品溶劑，或改進處理樣品的方法，或過濾，去除不溶性物質。
