目前,在分析儀器中，色譜儀器具有重要地位。由于色譜儀的色譜柱具有高效的分離能力，把物質按保留時間大小進行分離，然后通過與標樣保留時間進行對比的方法確定物質性質，因此對未知樣品很難定性分析。
而質譜聯用儀是直接測定物質的質量數與電荷的比值(m/z)在定性分析方面既準確又快速。把色譜與質譜聯合起來使用，實際上是把質譜儀作為色譜儀的一個通用檢測器來使用。
色譜儀有很多檢測器，如TCD、FID、ECD、FPD、NPD等，每種檢測器只有一定限度的適用范圍，不能通用，造成使用不便。而質譜儀作為質量檢測器可以取代色譜儀的多種檢測器，通用性強，使用極其方便。
所以說色-質聯用儀器把色譜的高效分離作用與質譜計對未知樣品的準確鑒別能力相結合，把分析儀器提高到一個新水平，凡是能使用色譜儀的地方，均可以使用色-質聯用儀器。
色-質聯用儀器在當前儀器分析中占有非常突出的地位。色-質聯用儀器是色譜技術、質譜技術與計算機技術三種現代化技術緊密結合的產物。
為了質譜儀器的正常工作，必須要組成高真空系統的真空室。儀器使用了高性能的渦輪分子泵與前級真空泵構成兩級真空機組以確保所需的真空。
被分析樣品經毛細管柱分離，進入離子源。采用電子電力標準配置(EI)，產生正離子，在推斥、聚焦、引出電極的作用下將正離子送入四極桿系統。
四極桿在高頻電壓與正負電壓聯合作用下形成高頻電場，在掃描電壓作用下，只有符合四極場運動方程的離子才能通過四極桿對稱中心到達離子檢測器，再經離子流放大器放大，產生質譜信號。
得到了質譜圖，通過解釋譜圖或進行譜庫檢索以識別未知樣品的組成。
