基因芯片技術(shù)是綜合利用一系列微電子技術(shù)，在有限的空間內(nèi)將核酸探針點(diǎn)到固相載體上，或者直接進(jìn)行探針固相原位合成，將一系列可尋址識(shí)別的核酸探針有序集成起來(lái)，用于同時(shí)進(jìn)行眾多的顯微核酸雜交反應(yīng)，可以同時(shí)檢測(cè)很多種核酸片段。基因芯片按其制作原理可以分為很多類，但目前真正成熟的，得以廣泛應(yīng)用的仍只有使用點(diǎn)樣或原位合成技術(shù)的微陣列（microarray）技術(shù)。
基因芯片檢測(cè)的生物學(xué)原理和前面所述的核酸探針*相似，所以可以說(shuō)基因芯片就是高密度的斑點(diǎn)雜交技術(shù)。但正因?yàn)槠涓呙芏龋瑢?dǎo)致了一個(gè)量變到質(zhì)變的過(guò)程，成為炙手可熱的一種新生物技術(shù)。
基因芯片與檢驗(yàn)檢疫醫(yī)學(xué)關(guān)系密切，它為檢驗(yàn)檢疫工作提供了一種全新的技術(shù)，使一些檢驗(yàn)檢疫工作中難解決的問(wèn)題成為可能。現(xiàn)有的檢驗(yàn)檢疫方法大多數(shù)只是檢測(cè)單一因素或單一種類的疫病，但由于人體和疾病的復(fù)雜性，單一因素或單一種類的疫病的檢測(cè)在很多情況下有很強(qiáng)的局限性，而芯片技術(shù)提供了一種大大突破這種局限性的解決思路，因?yàn)樗軌蛲瑫r(shí)檢測(cè)很多種因素和很多種疫病。
下面以一款呼吸道疾病通用檢測(cè)芯片為例介紹一下基因芯片在檢驗(yàn)檢疫中的應(yīng)用：①將呼吸道的各種致病菌特征基因片段全部制作成探針，有序點(diǎn)制到固相載體上，制成芯片；②提取樣品中的核酸，并對(duì)核酸進(jìn)行特異性或非特異性的擴(kuò)增；③將擴(kuò)增產(chǎn)物與芯片雜交檢測(cè)；④分析檢測(cè)結(jié)果，判定樣品中含有哪些病原微生物。
目前，基因芯片短期內(nèi)仍難以在動(dòng)物檢驗(yàn)檢疫得到廣泛應(yīng)用。其原因有：①檢測(cè)的靈敏度需要加強(qiáng)；②檢測(cè)的質(zhì)控體系有待完善；③檢測(cè)的成本太高。
DNA測(cè)序傳統(tǒng)的方法是Maxam和Gilbert的化學(xué)法及Sanger的末端鏈終止法，但隨著分子生物學(xué)的飛速發(fā)展，尤其是近年來(lái)人類基因組測(cè)序（HGP）和其他眾多基因組測(cè)序工作的完成，大規(guī)模測(cè)序的技術(shù)日臻成熟。
DNA測(cè)序?qū)τ趧?dòng)物檢驗(yàn)檢疫工作而言，一般是用于對(duì)上述各種方法的進(jìn)一步確認(rèn)，而這種確認(rèn)往往是不必要的，所以只是在上述方法出現(xiàn)模棱兩可的情況時(shí)，才考慮DNA測(cè)序進(jìn)行確認(rèn)。
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