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微生物“暗物質(zhì)”如何致???

時(shí)間:2014-12-29閱讀:817
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PNAS:微生物“暗物質(zhì)

現(xiàn)代生物學(xué)中的一個(gè)重要發(fā)現(xiàn)是,人體中含有比人體細(xì)胞多出10倍的細(xì)菌細(xì)胞。但是,這些細(xì)菌對(duì)科學(xué)家來說仍然是個(gè)謎。

據(jù)科學(xué)家估計(jì),生活在人體內(nèi)的細(xì)菌中有大約一半,因無法在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng),而幾乎不為人所知,也因此科學(xué)家稱其為“微生物暗物質(zhì)"。然而,科學(xué)家們一直決心要了解更多關(guān)于這些不可培養(yǎng)細(xì)菌的信息,因?yàn)樗鼈兛赡軙?huì)導(dǎo)致某些使人衰弱的和慢性疾病的發(fā)展。

幾十年來,已經(jīng)構(gòu)成研究人員一個(gè)特別挑戰(zhàn)的菌群是Candidate Phylum TM7,據(jù)認(rèn)為它能引起炎性粘膜病,因?yàn)樗诨加醒乐苎祝ㄒ环N牙齦感染)的人們當(dāng)中非常普遍。

現(xiàn)在,加州大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)牙醫(yī)學(xué)院、J. Craig Venter研究所和華盛頓大學(xué)牙科學(xué)院的科學(xué)家們?nèi)〉玫囊豁?xiàng)里程碑式結(jié)果,闡述了TM7在牙周炎等疾病進(jìn)展中的作用。他們的研究結(jié)果揭示了TM7在生物學(xué)、生態(tài)學(xué)和醫(yī)學(xué)中的重要性,并可能帶領(lǐng)我們更好地了解其他難以捉摸的細(xì)菌。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在12月22日的《PNAS》雜志。

UCLA口腔生物學(xué)教授Wenyuan Shi博士稱:“我認(rèn)為,這是我30年職業(yè)生涯中一項(xiàng)zui令人興奮的發(fā)現(xiàn)。這項(xiàng)研究為我們使每一種不可培養(yǎng)的細(xì)菌變的可培養(yǎng),提供了路線圖。"

研究人員培育了一種特定類型的TM7,稱為TM7x,存在于人類口腔中的TM7的版本,發(fā)現(xiàn)了該細(xì)菌和致病因子(稱為溶齒放線菌XH001,可引起黏膜炎癥)之間信號(hào)交互的證據(jù)。

華盛頓大學(xué)牙科學(xué)院代理副教授Jeff McLean博士稱:“一旦我們培養(yǎng)了TM7x并對(duì)其進(jìn)行測(cè)序,我們zui終就可以弄清它在人體內(nèi)是如何生存的。這可能是‘兩種不同細(xì)菌之間寄生性附著’的*個(gè)例子。"

為了證明TM7x需要XH001才能生長(zhǎng)和生存,研究小組試圖將隔離的TM7x細(xì)胞與其他細(xì)菌菌株混合。只有XH001才能與TM7x建立一種物理,這讓研究人員相信,TM7x和XH001可能在它們?cè)诳谇坏慕⑦^程中就已經(jīng)共同進(jìn)化。

TM7x更有趣的地方在于,它可能在消化道慢性炎癥、陰道炎和牙周炎中起著一定作用。這項(xiàng)研究中所收集的混合培養(yǎng),有史以來*次可讓研究人員檢測(cè),TM7x在何種程度上可導(dǎo)致這些疾病。

美國(guó)國(guó)家牙科研究所和顱面研究微生物項(xiàng)目主任R. Dwayne Lunsford博士指出:“不可培養(yǎng)的細(xì)菌,為口腔微生物學(xué)家提供了一個(gè)迷人的‘zui后新領(lǐng)域’,是NIDCR研究組合的一項(xiàng)首要重點(diǎn)。這項(xiàng)研究對(duì)‘共培養(yǎng)策略和種間信號(hào)全面鑒別如何有助于這些難懂生物的恢復(fù)’提供了一個(gè)近乎的案例。雖然免培養(yǎng)的研究可使我們對(duì)特定部位的微生物多樣性略有所了解,但是為了真正理解一個(gè)隔離種群的生理學(xué)和毒性,我們zui終必須能夠在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)和操縱這些細(xì)菌。"

以前我們知道,XH001可誘導(dǎo)炎癥。但是僅僅通過用XH001感染骨髓細(xì)胞,然后與TM7x/XH001共培養(yǎng),研究人員也發(fā)現(xiàn),當(dāng)TM7x與XH001物理附著的時(shí)候,炎癥顯著降低。這是提供TM7和XH001之間這種關(guān)系證據(jù)的*已知的研究。

研究人員計(jì)劃進(jìn)一步研究TM7x和XH001之間的*關(guān)系,以及它們?nèi)绾喂餐瑢?dǎo)致了黏膜疾病。他們的研究結(jié)果可能對(duì)潛在的治療方法有一定的影響。

原文檢索:

Xuesong He, Jeffrey S. McLean, Anna Edlund, Shibu Yooseph, Adam P. Hall, Su-Yang Liu,Pieter C. Dorrestein, Eduardo Esquenazi, Ryan C. Hunter, Genhong Cheng, Karen E. Nelson,Renate Lux, and Wenyuan Shi. C*tion of a human-associated TM7 phylotype reveals a reduced genome and epibioticparasitic lifestyle. PNAS, December 22, 2014, doi:10.1073/pnas.1419038112

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