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基因檢測發現意義不明的變異

閱讀:640發布時間:2015-7-31

研究所的研究人員在會上表示,在利用新一代測序的基因檢測集合來篩查患者時,他們發現了一些意義不明的變異。

研究人員篩查了12名婦女,她們缺乏BRCA1BRCA2突變,但有著其他的乳腺癌相關突變。研究人員發現,其中8名婦女帶有意義不明的變異。之后,她們再次研究了這些變異的意義,發現一些能夠被歸為良性,而另一些是可能有害的。

乳腺癌是*婦女的*殺手,大約有5-10%的癌癥是遺傳的。盡管BRCA1BRCA2突變占了遺傳性乳腺癌病例的近半數,但是其他基因的變異也與疾病風險相關,這就給診斷帶來了挑戰。

除了開發BRCA1BRCA2的基因檢測,研究人員還開發了一種名為Breast Cancer Panel 2BCP2)的檢測,針對15個基因中的變異,包括ATMCHEK2PTENRAD50TP53

研究人員利用BCP212名缺乏BRCA1BRCA2突變的婦女進行篩查。她們從每名患者的外周血樣本中提取DNA,并在Thermo Fisher Ion PGM測序儀上進行測序,之后通過Sanger測序來驗證。根據獲得的報告,她們在文獻中搜索那些結果可能意味著什么。

研究人員表示,報告可能是三種結果中的一種:陽性結果,發現已知的致病變異;發現VUS;陰性結果,未發現任何已知的致病變異或VUS。不過,她指出,陰性結果也不一定是結論性的,因為婦女可能在她們未檢測的基因中帶有突變。

在這項研究中,研究人員無法在4名患者的樣本中上找到臨床突變,而在另外8名患者中,她們發現了一個或多個基因帶有臨床意義不明的變異。其中,4名患者是ATM基因有VUS,而3名患者是PALB2基因有VUSTorrezan表示,許多VUS是新生錯義突變或次要等位基因頻率低的錯義突變。

不過,研究人員補充道,一些VUS的狀態已經改變。在她準備演講稿時,再次進行數據庫的搜索,發現PALB2CHEK2中的VUS已經被分別歸類為良性和危害性。她認為,這也強調了計算機分析工具的重要性,必須保持數據庫更新,并開展不同變異的功能研究,才能了解它們的意義。


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