非編碼RNA是指不編碼蛋白質的RNA。真核生物的非編碼RNA廣泛參與了關鍵性細胞功能的調控。隨著測序技術的飛速發展，研究者們發現了越來越多的新型非編碼RNA，比如lncRNA、環狀RNA、piRNA等等。非編碼RNA的豐度、保守性、結構和功能多樣性，不僅豐富了我們的細胞生物學知識，還挑戰了我們一直以來對真核生物基因組的認識。
介紹了一個以CRISPR-Cas9為基礎的基因組靶向技術，CRISPR-Display。細菌一直在與病毒或入侵核酸進行斗爭，為此它們演化出了多種防御機制，CRISPR/Cas適應性免疫系統就是其中之一。規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合，可以在引導RNA的指引下，靶標并切割入侵者的遺傳物質。
在CRISP-Disp系統中，失去催化活性的dCas9作為可編程的DNA結合蛋白，其特異性由引導RNA決定，gRNA上融合有異源的效應結構域。研究人員摸索出的gRNA-ncRNA融合方法，能將非編碼RNA帶到特定DNA位點，同時不影響dCas9的功能和活性。
對合成生物學研究者來說，CRISP-Disp的靈活性、模塊化和多重化特性是很有吸引力的。據介紹，CRISP-Disp系統可以容納約4.8 kb的RNA結構域，這相當于天然lncRNA的長度。除了lncRNA以外，研究人員還對各種天然和人工非編碼RNA進行了測試。研究表明，gRNA可以偶聯多個非編碼RNA結構域，這些結構域可以同時且獨立的起作用。用CRISP-Disp招募RNA-蛋白復合體到特定位點，可以設計出復雜的基因調控回路。
除了合成生物學應用，CRISP-Disp還是一個研究非編碼RNA功能的強大工具，包括近來備受關注的lncRNA。盡管人們為了理解lncRNA的功能和作用機制已經做出了很多努力，但能夠全面靶標和分析lncRNA的平臺并不多，還有很多問題沒有得到解答。
還有一些非編碼RNA也涉及了基因表達的激活。舉例來說，在很多情況下基因表達需要增強子區域轉錄的RNA。然而，我們至今還不清楚eRNA究竟是如何起作用的，比如它可能改變DNA的拓撲結構，讓增強子和啟動子靠近。如果eRNA的激活功能是其序列的內在特性，那么將它添加到CRISP-Disp系統中就可以活化位置的任何基因。但就目前的研究結果來看，eRNA并沒有在這個體系中起到強力的基因激活作用。這些結果支持了之前人們提出的假說，該假說認為eRNA可能是基因座特異性增強子復合體中的一個元件。
