隨著微生物快速檢測法的不斷發展，很多檢驗技術日趨成熟和完善，并被人們進一步開發研制成自動或半自動微生物檢測儀。全自動微生物分析系統。該裝置的zui大特點在于同微生物檢測應用的傳統方法有著明顯的變革，它無須經過微生物分離培養和純化過程，就能直接從樣品檢出特殊的微生物種類和菌群來。能同時進行60個～200個樣品的分析，速度快、易操作、結果準確，適用于各類細菌的檢驗和鑒定。
另外，免疫診斷檢測系統是一種從混合細菌或細胞中分離和分析細胞、微生物或細胞個體類型的自動化儀器，近年已被用于DNA含量、染色體組成及細胞表面標記等物質的測定。MClelland R D和Dinder A C用該儀器結合單克隆抗體檢測食品中的沙門氏菌，靈敏度達到0.1c f u／g 。
蛋白質指紋圖譜技術是隨著蛋白質組學興起的一種新技術，用于各種疾病特異性蛋白指紋的識別和判斷，可以直接檢測不經處理的尿液、血液或細胞裂解液等。人體血清里有成千上萬個蛋白，人一旦發生了某種疾病，蛋白質成分就必然會起變化。研究員利用“蛋白質質譜指紋圖譜”技術及其檢測辦法，可以分析得出SARS與非SAR S病人血清中的蛋白質成分變化。該技術不是利用單獨的蛋白質峰的出現和消失來判斷SARS，而是用5個蛋白質峰的出現和消失來判斷，好比刑偵破案中甄別5個手指的指紋， 故此稱為“指紋圖譜”。
質譜儀通過復雜的計算能夠記住S A R S 病人血清里蛋白質的圖譜， 通過對質譜儀的“訓練”之后，它就能夠根據人體血清中的特異變化，靈敏地辨別出測試的對象是否感染了S AR S病毒。這種檢測方法陽性率接近9 5％， 特異性將近9 6％，能在病人發燒的*天即可以得出滿意的檢測結果。只需要一滴血，將采集到的病人血樣現場直接放到9m o l／L的尿素里，病毒可以迅速溶解滅活，這樣在一般醫院的化驗室里即可實現安全操作，從而防止交叉感染。有專家稱蛋白質指紋圖譜技術標志著一種劃時代的診斷模式的誕生。
