由于化學成分品種繁多，在制藥生產過程中使用了多種原料，生產工藝復雜多變，產生的廢水等成分也十分復雜處理有一定的難度，因此化學制藥廢水治理zui重要的是根據廢水的特點、性質選擇*的處理方法。
       隨著我國醫藥工業的發展，化學制藥廢水已逐漸成為重要的污染源之一，如何處理該類廢水是當今環境保護的一個難題。目前化學制藥廢水的處理方法可歸納為以下幾種：物化處理、化學處理、生化處理以及多種方法的組合處理等，各種處理方法具有各自的優勢及不足。
       制藥廢水的水質特點使得多數制藥廢水采用單一的方法根本無法達標，因此在生化處理前必須進行必要的預處理。一般應設調節池，調節水質水量和pH，且根據實際情況采用某種物化或化學法作為預處理工序，以降低水中的SS、鹽度及部分COD，減少廢水中的生物抑制性物質，并提高廢水的可降解性，以利于廢水的后續生化處理。預處理后的廢水，可根據其水質特征選取某種厭氧和好氧工藝進行處理，若出水要求較高，好氧處理工藝后還需繼續進行后處理。具體工藝的選擇應綜合考慮廢水的性質、工藝的處理效果、基建投資及運行維護等因素，做到技術可行，經濟合理。總的工藝路線為預處理－厭氧－好氧－（后處理）組合工藝。
       化學制藥廢水是一種成分復雜、毒性高、含難降解有機物質的有機廢水，目前的處理方法有預處理-生物處理。工程應用以單元處理為主，因此開發經濟、有效的復合水處理單元迫在眉睫。此外，新技術如膜技術、生物強化技術等的應用在化學制藥廢水處理方面有更廣闊的應用前景。
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