近年來，制藥行業成為環境污染的高發事件，在產過程制藥業使用多種原料，同時生產工藝復雜多變，產生的廢水等成分也十分復雜,是目前*的三大難處理工業廢水之一，同時也是國家環保規劃中重點治理的12個行業之一。
       制藥廢水大多數具有有機物濃度高、色度高、含難降解和對微生物有毒性的物質、水質成分復雜、可生化性差等特點。廢水中的殘留抗生素和高濃度有機物使傳統生物處理法很難達到預期的處理效果，因殘留抗生素對微生物的強烈抑制作用使好氧菌中毒，造成好氧處理困難；而厭氧處理高濃度的有機物又難以滿足出水達標，還需進一步處理。
       制藥行業較為特殊，它涉及到抗生素的問題。制藥行業分為幾大類，每類都有各自的排放標準，而且制藥企業所在的地區也有地方政府制定的污染排放標準，目前國家制定的許多技術政策大多都是從理念出發，推薦一些主流的技術工藝。就制藥行業而言，zui核心的技術是厭氧好氧的組合工藝，另外預處理方面有微電解、鐵碳微電解-Fenton、混凝沉淀、強化吸附、臭氧氧化等氧化系列的一些工藝，后期還有膜處理、離子交換、深度過濾等技術。
       制藥行業分生物制藥與化學制藥。含抗生素的污水，水質特性較多，經處理后能勉強達標排放，但含有*、四環素等物質的污水目前還沒有很好的工藝。另外，制藥污水還需解決溶媒散發的刺激性氣味的問題，揮發性物質散發到空間中，會對周邊環境造成很大影響。制藥中菌渣對環境和生態造成影響，它的滅活問題國家已開始重視，有了一些科研立項，現在重點關注的是污水排放及含菌渣污泥的處理。對于環保法的修訂，個人的一點看法是罰款額度太低，對違法行為起不到約束作用。
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