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上海科鑒生物科技有限公司
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閱讀:380發布時間:2013-5-27
近日,復旦大學公共衛生學院青年教師熊成龍、張志杰等以*的生物信息學為手段,對本次H7N9禽流感病毒基因進行研究和分析,找到了該病毒的起源和演化規律,發現該病毒的兩個zui重要蛋白HA和NA并非如此前中外學術界專家所認為的“分別來源于中國和韓國禽類”,而是起源于中國華東地區的家禽或野鳥。
該成果對預防和溯源流感與禽流感有重要意義,相關論文已在線發表在美國《臨床感染病》雜志上。
今年2月起,我國華東地區陸續出現系列流感樣病例,對于該病毒的起源,中外學術界普遍認為來自中韓禽類。他們的根據是:采集到的1株H7亞型HA(即H7N3病毒)來源于中國杭州的杭州鴨,而采集到的7株N9亞型NA(即H7N9病毒)則來源于韓國禽類。
該團隊認同中外學術界對HA來源的結論,但對NA來源則有異議。為此,研究人員分析了共享的流感數據庫。其中長度大于1000核苷酸的N9基因序列共321個NA序列,并由此推導出相應的蛋白質氨基酸序列,zui終證實,H7N9禽流感病毒的zui重要蛋白HA(N9基因)來源于中國江蘇洪澤湖花臉鴨。
研究人員認為“zui重要的依據”是,從基因的核苷酸和蛋白質氨基酸序列相似性搜索結果來看,H7N9病毒的zui重要蛋白NA與H11N9病毒在核苷酸和氨基酸層次上序列的相似性分別是96.2%和96.8%;而7株韓國株NA亞型株相似性分別為93.3%至95.5%和87.9%至96.4%。前者遠高于后者。
研究人員還認為,杭州是H7N3病毒的分離地,也是本次流感流行的主要疫區之一,洪澤湖區也是H11N9病毒的分離地。也就是說,從本次流感zui初發生地、H7亞型HA貢獻株分離地以及H11N9病毒分離地點來看,均位于中國的華東地區,從地理位置上來看,病毒株發生重組的可能性也遠高于韓國株。
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